RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384269.1

RNU6-842P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 842, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-842P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-842P-201ENST00000384269 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-4.8□□□□□ -3.18
RNU6-842P-201ENST00000384269 PDCD5O14737 125 aa-4.8□□□□□ -3.18
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-4.8□□□□□ -3.18
RNU6-842P-201ENST00000384269 PLNP26678 52 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM2Q9BVW6 85 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-842P-201ENST00000384269 CPS1P31327 1500 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-842P-201ENST00000384269 USP34Q70CQ2 3546 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-842P-201ENST00000384269 CLTCL1P53675 1640 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-4.92□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 EFCAB5A4FU69 1503 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 TRPM2O94759 1503 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-4.95□□□□□ -3.2
RNU6-842P-201ENST00000384269 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-842P-201ENST00000384269 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB133Q30KQ1 61 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-842P-201ENST00000384269 XIRP2A4UGR9 3374 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-842P-201ENST00000384269 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-842P-201ENST00000384269 UNC80Q8N2C7 3258 aa-5.06□□□□□ -3.22
RNU6-842P-201ENST00000384269 IQGAP1P46940 1657 aa-5.1□□□□□ -3.23
RNU6-842P-201ENST00000384269 A0A087WWC5 75 aa-5.11□□□□□ -3.23
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-5.15□□□□□ -3.23
RNU6-842P-201ENST00000384269 TOMM7Q9P0U1 55 aa-5.15□□□□□ -3.23
RNU6-842P-201ENST00000384269 NFAT5O94916 1531 aa-5.15□□□□□ -3.23
RNU6-842P-201ENST00000384269 LOC400499M0QZD8 3231 aa-5.16□□□□□ -3.24
RNU6-842P-201ENST00000384269 PRXQ9BXM0 1461 aa-5.17□□□□□ -3.24
RNU6-842P-201ENST00000384269 NDUFA1O15239 70 aa-5.2□□□□□ -3.24
RNU6-842P-201ENST00000384269 CD52P31358 61 aa-5.2□□□□□ -3.24
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM5Q71RC9 77 aa-5.2□□□□□ -3.24
RNU6-842P-201ENST00000384269 HTN1P15515 57 aa-5.22□□□□□ -3.25
RNU6-842P-201ENST00000384269 A0A096LNI7 61 aa-5.29□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 ABCC8Q09428 1581 aa-5.3□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 ADCY10Q96PN6 1610 aa-5.3□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 ASPMQ8IZT6 3477 aa-5.33□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-5.33□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 CMC2Q9NRP2 79 aa-5.34□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-5.34□□□□□ -3.26
RNU6-842P-201ENST00000384269 VCANP13611 3396 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-842P-201ENST00000384269 BRCA2P51587 3418 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-842P-201ENST00000384269 CENPFP49454 3210 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB124Q8NES8 71 aa-5.53□□□□□ -3.29
RNU6-842P-201ENST00000384269 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-5.57□□□□□ -3.3
RNU6-842P-201ENST00000384269 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-5.58□□□□□ -3.3
RNU6-842P-201ENST00000384269 CDH23Q9H251 3354 aa-5.61□□□□□ -3.31
RNU6-842P-201ENST00000384269 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-5.71□□□□□ -3.32
RNU6-842P-201ENST00000384269 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-5.74□□□□□ -3.33
RNU6-842P-201ENST00000384269 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-5.76□□□□□ -3.33
RNU6-842P-201ENST00000384269 VPS13AQ96RL7 3174 aa-5.79□□□□□ -3.34
RNU6-842P-201ENST00000384269 LINC01556Q5JQF7 62 aa-5.93□□□□□ -3.36
RNU6-842P-201ENST00000384269 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-5.94□□□□□ -3.36
RNU6-842P-201ENST00000384269 ATP7AQ04656 1500 aa-5.95□□□□□ -3.36
RNU6-842P-201ENST00000384269 MROH2BQ7Z745 1585 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-842P-201ENST00000384269 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-842P-201ENST00000384269 H3BUX3 64 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-842P-201ENST00000384269 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-842P-201ENST00000384269 UTRNP46939 3433 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-842P-201ENST00000384269 IQGAP2Q13576 1575 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-842P-201ENST00000384269 TOMM5Q8N4H5 51 aa-6.5□□□□□ -3.45
RNU6-842P-201ENST00000384269 APELAP0DMC3 54 aa-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-842P-201ENST00000384269 K7EIM0 57 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-842P-201ENST00000384269 A0A096LPF7 62 aa-6.63□□□□□ -3.47
RNU6-842P-201ENST00000384269 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-6.74□□□□□ -3.49
RNU6-842P-201ENST00000384269 PRCDQ00LT1 54 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-842P-201ENST00000384269 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-6.89□□□□□ -3.51
RNU6-842P-201ENST00000384269 HTN3P15516 51 aa-6.93□□□□□ -3.52
RNU6-842P-201ENST00000384269 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-7.15□□□□□ -3.55
RNU6-842P-201ENST00000384269 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-7.25□□□□□ -3.57
RNU6-842P-201ENST00000384269 Q9Y3F1 56 aa-7.27□□□□□ -3.57
RNU6-842P-201ENST00000384269 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-7.31□□□□□ -3.58
RNU6-842P-201ENST00000384269 RPL39P5Q59GN2 51 aa-7.44□□□□□ -3.6
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB108AA8MXU0 73 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 H3BSH0 61 aa-7.56□□□□□ -3.62
RNU6-842P-201ENST00000384269 COX14Q96I36 57 aa-7.77□□□□□ -3.65
RNU6-842P-201ENST00000384269 DEFB108BQ8NET1 73 aa-8.12□□□□□ -3.71
RNU6-842P-201ENST00000384269 STATHP02808 62 aa-8.97□□□□□ -3.85
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.4 ms