RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.97□□□□□ -1.45
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP12-1P59990 96 aa5.97□□□□□ -1.45
SPIN3-241ENST00000640511 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.95□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.95□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-1P60331 282 aa5.94□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.93□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.92□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 RYR2Q92736 4967 aa5.92□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.91□□□□□ -1.46
SPIN3-241ENST00000640511 PKD1P98161 4303 aa5.89□□□□□ -1.47
SPIN3-241ENST00000640511 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SPIN3-241ENST00000640511 PKHD1P08F94 4074 aa5.87□□□□□ -1.47
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1B0GVY2 172 aa5.83□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 RYR3Q15413 4870 aa5.83□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.82□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 J3QL48 77 aa5.81□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SPIN3-241ENST00000640511 M0QZ58 72 aa5.77□□□□□ -1.49
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-8P60410 259 aa5.76□□□□□ -1.49
SPIN3-241ENST00000640511 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.73□□□□□ -1.49
SPIN3-241ENST00000640511 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.71□□□□□ -1.5
SPIN3-241ENST00000640511 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SPIN3-241ENST00000640511 FAT1Q14517 4588 aa5.7□□□□□ -1.5
SPIN3-241ENST00000640511 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SPIN3-241ENST00000640511 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.62□□□□□ -1.51
SPIN3-241ENST00000640511 Q5VSD8 79 aa5.62□□□□□ -1.51
SPIN3-241ENST00000640511 PP632Q6XCG6 107 aa5.62□□□□□ -1.51
SPIN3-241ENST00000640511 RYR1P21817 5038 aa5.59□□□□□ -1.51
SPIN3-241ENST00000640511 HSPG2P98160 4391 aa5.58□□□□□ -1.52
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SPIN3-241ENST00000640511 R4GN34 69 aa5.53□□□□□ -1.52
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.5□□□□□ -1.53
SPIN3-241ENST00000640511 MYCBP2O75592 4640 aa5.5□□□□□ -1.53
SPIN3-241ENST00000640511 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.45□□□□□ -1.54
SPIN3-241ENST00000640511 INE1O15225 51 aa5.44□□□□□ -1.54
SPIN3-241ENST00000640511 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.43□□□□□ -1.54
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.42□□□□□ -1.54
SPIN3-241ENST00000640511 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.41□□□□□ -1.54
SPIN3-241ENST00000640511 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.38□□□□□ -1.55
SPIN3-241ENST00000640511 TNXBP22105 4242 aa5.34□□□□□ -1.55
SPIN3-241ENST00000640511 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.33□□□□□ -1.56
SPIN3-241ENST00000640511 MT1HL1P0DM35 61 aa5.32□□□□□ -1.56
SPIN3-241ENST00000640511 HERC2O95714 4834 aa5.32□□□□□ -1.56
SPIN3-241ENST00000640511 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.22□□□□□ -1.57
SPIN3-241ENST00000640511 TNP1P09430 55 aa5.19□□□□□ -1.58
SPIN3-241ENST00000640511 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.16□□□□□ -1.58
SPIN3-241ENST00000640511 LPAP08519 4548 aa5.11□□□□□ -1.59
SPIN3-241ENST00000640511 HERC1Q15751 4861 aa5.07□□□□□ -1.6
SPIN3-241ENST00000640511 LRP2P98164 4655 aa5.07□□□□□ -1.6
SPIN3-241ENST00000640511 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.93□□□□□ -1.62
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.82□□□□□ -1.64
SPIN3-241ENST00000640511 MUC2Q02817 5179 aa4.8□□□□□ -1.64
SPIN3-241ENST00000640511 LCE3AQ5TA76 89 aa4.79□□□□□ -1.64
SPIN3-241ENST00000640511 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.78□□□□□ -1.64
SPIN3-241ENST00000640511 MUC17Q685J3 4493 aa4.78□□□□□ -1.64
SPIN3-241ENST00000640511 RNF213Q63HN8 5207 aa4.74□□□□□ -1.65
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SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.66□□□□□ -1.66
SPIN3-241ENST00000640511 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.62□□□□□ -1.67
SPIN3-241ENST00000640511 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-12P60413 245 aa4.6□□□□□ -1.67
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.6□□□□□ -1.67
SPIN3-241ENST00000640511 M0R2T5 61 aa4.6□□□□□ -1.67
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP12-3P60328 96 aa4.54□□□□□ -1.68
SPIN3-241ENST00000640511 LCE2CQ5TA81 110 aa4.54□□□□□ -1.68
SPIN3-241ENST00000640511 MT1HP80294 61 aa4.49□□□□□ -1.69
SPIN3-241ENST00000640511 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.46□□□□□ -1.7
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-5P60370 271 aa4.39□□□□□ -1.71
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.39□□□□□ -1.71
SPIN3-241ENST00000640511 MT2AP02795 61 aa4.32□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.3□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 MT1FP04733 61 aa4.3□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.3□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.29□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.29□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.29□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SPIN3-241ENST00000640511 MT1XP80297 61 aa4.19□□□□□ -1.74
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.19□□□□□ -1.74
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.14□□□□□ -1.75
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.12□□□□□ -1.75
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.1□□□□□ -1.75
SPIN3-241ENST00000640511 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SPIN3-241ENST00000640511 LCE2BO14633 110 aa4.06□□□□□ -1.76
SPIN3-241ENST00000640511 MT1BP07438 61 aa4.05□□□□□ -1.76
SPIN3-241ENST00000640511 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.05□□□□□ -1.76
SPIN3-241ENST00000640511 USH2AO75445 5202 aa4.03□□□□□ -1.76
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP12-4P60329 112 aa4.01□□□□□ -1.77
SPIN3-241ENST00000640511 KMT2DO14686 5537 aa3.93□□□□□ -1.78
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.9□□□□□ -1.78
SPIN3-241ENST00000640511 SSPOA2VEC9 5147 aa3.89□□□□□ -1.79
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.86□□□□□ -1.79
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.83□□□□□ -1.8
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.83□□□□□ -1.8
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.81□□□□□ -1.8
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