RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	HSPG2	P98160	4391 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	CSAG1	Q6PB30	78 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	PKD1	P98161	4303 aa		3.97	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	PKHD1	P08F94	4074 aa		3.96	□□□□□ -1.77
USP7-217	ENST00000567329	PANO1	I0J062	215 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.95	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.92	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329		A8MUU9	505 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
USP7-217	ENST00000567329		A0A087WTM6	91 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	ROMO1	P60602	79 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZSA8	131 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP7-217	ENST00000567329	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329		A0A1B0GU33	70 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329		H0YAA0	97 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329		Q5VSD8	79 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329		K7ERS5	55 aa		3.81	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		3.81	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		3.8	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	FAT1	Q14517	4588 aa		3.79	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	SPINK1	P00995	79 aa		3.78	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.78	□□□□□ -1.8
USP7-217	ENST00000567329	MT3	P25713	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.73	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329		P0C880	135 aa		3.72	□□□□□ -1.81
USP7-217	ENST00000567329	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.71	□□□□□ -1.82
USP7-217	ENST00000567329	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.7	□□□□□ -1.82
USP7-217	ENST00000567329	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.68	□□□□□ -1.82
USP7-217	ENST00000567329	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
USP7-217	ENST00000567329	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.64	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.62	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.61	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
USP7-217	ENST00000567329	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329	CRIPT	Q9P021	101 aa		3.58	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329	LRP2	P98164	4655 aa		3.58	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329		S4R3F8	94 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP7-217	ENST00000567329	TNXB	P22105	4242 aa		3.52	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.5	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329		M0QZ58	72 aa		3.48	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329	LPA	P08519	4548 aa		3.47	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.47	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.47	□□□□□ -1.85
USP7-217	ENST00000567329		A0A0D9SG42	100 aa		3.46	□□□□□ -1.86
USP7-217	ENST00000567329	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.46	□□□□□ -1.86
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.45	□□□□□ -1.86
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.4	□□□□□ -1.87
USP7-217	ENST00000567329	MUC2	Q02817	5179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
USP7-217	ENST00000567329	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP7-217	ENST00000567329	PLAC4	Q8WY50	150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP7-217	ENST00000567329	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP7-217	ENST00000567329	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.31	□□□□□ -1.88
USP7-217	ENST00000567329	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.31	□□□□□ -1.88
USP7-217	ENST00000567329	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.28	□□□□□ -1.88
USP7-217	ENST00000567329	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.23	□□□□□ -1.89
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.22	□□□□□ -1.89
USP7-217	ENST00000567329		R4GN34	69 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP7-217	ENST00000567329	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP7-217	ENST00000567329	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP7-217	ENST00000567329	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP7-217	ENST00000567329	MT1H	P80294	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP7-217	ENST00000567329	TNP1	P09430	55 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP7-217	ENST00000567329	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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