RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	XP32	Q5T750	250 aa		9.52	□□□□□ -0.89
RRN3-205	ENST00000563559		K7ERS5	55 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01554	Q52M75	96 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RRN3-205	ENST00000563559	CSAG1	Q6PB30	78 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RRN3-205	ENST00000563559	RYR1	P21817	5038 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RRN3-205	ENST00000563559		S4R3F8	94 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RRN3-205	ENST00000563559	MYCBP2	O75592	4640 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRN3-205	ENST00000563559	MT1HL1	P0DM35	61 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRN3-205	ENST00000563559	RYR3	Q15413	4870 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		9.3	□□□□□ -0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		9.28	□□□□□ -0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TPRXL	Q17RH7	258 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RRN3-205	ENST00000563559	ROMO1	P60602	79 aa		9.19	□□□□□ -0.94
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0D9SG42	100 aa		9.16	□□□□□ -0.94
RRN3-205	ENST00000563559		P0C880	135 aa		9.16	□□□□□ -0.94
RRN3-205	ENST00000563559	LRP2	P98164	4655 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RRN3-205	ENST00000563559	LPA	P08519	4548 aa		9.01	□□□□□ -0.97
RRN3-205	ENST00000563559		M0QZ58	72 aa		9.01	□□□□□ -0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CRIPT	Q9P021	101 aa		9.01	□□□□□ -0.97
RRN3-205	ENST00000563559	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	8.95	□□□□□ -0.98
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP12-2	P59991	146 aa		8.95	□□□□□ -0.98
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP12-1	P59990	96 aa		8.92	□□□□□ -0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		8.89	□□□□□ -0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		8.85	□□□□□ -0.99
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		8.83	□□□□□ -1
RRN3-205	ENST00000563559		R4GN34	69 aa		8.74	□□□□□ -1.01
RRN3-205	ENST00000563559	MUC17	Q685J3	4493 aa		8.73	□□□□□ -1.01
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		8.72	□□□□□ -1.01
RRN3-205	ENST00000563559		J3QL48	77 aa		8.71	□□□□□ -1.01
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		8.62	□□□□□ -1.03
RRN3-205	ENST00000563559	HERC2	O95714	4834 aa		8.57	□□□□□ -1.04
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		8.52	□□□□□ -1.05
RRN3-205	ENST00000563559	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
RRN3-205	ENST00000563559		H3BS24	57 aa		8.5	□□□□□ -1.05
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		8.42	□□□□□ -1.06
RRN3-205	ENST00000563559	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	8.39	□□□□□ -1.07
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		8.37	□□□□□ -1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		8.29	□□□□□ -1.08
RRN3-205	ENST00000563559	MUC2	Q02817	5179 aa		8.23	□□□□□ -1.09
RRN3-205	ENST00000563559	PP632	Q6XCG6	107 aa		8.23	□□□□□ -1.09
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF8	A1L188	74 aa		8.17	□□□□□ -1.1
RRN3-205	ENST00000563559	HERC1	Q15751	4861 aa		8.15	□□□□□ -1.11
RRN3-205	ENST00000563559	PLAC4	Q8WY50	150 aa		8.12	□□□□□ -1.11
RRN3-205	ENST00000563559	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		8.12	□□□□□ -1.11
RRN3-205	ENST00000563559	TNP1	P09430	55 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RRN3-205	ENST00000563559	LCE2C	Q5TA81	110 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RRN3-205	ENST00000563559	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.99	□□□□□ -1.13
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.99	□□□□□ -1.13
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		7.94	□□□□□ -1.14
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2T5	61 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RRN3-205	ENST00000563559	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RRN3-205	ENST00000563559	MT1H	P80294	61 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RRN3-205	ENST00000563559	LUZP6	Q538Z0	58 aa		7.79	□□□□□ -1.16
RRN3-205	ENST00000563559	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-10	P60014	251 aa		7.7	□□□□□ -1.18
RRN3-205	ENST00000563559	MT2A	P02795	61 aa		7.69	□□□□□ -1.18
RRN3-205	ENST00000563559	MT1F	P04733	61 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RRN3-205	ENST00000563559	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RRN3-205	ENST00000563559	LCE3A	Q5TA76	89 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RRN3-205	ENST00000563559	MT1B	P07438	61 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-5	P60370	271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RRN3-205	ENST00000563559	MT1X	P80297	61 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0A0MQY5	61 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-12	P60413	245 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RRN3-205	ENST00000563559	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RRN3-205	ENST00000563559	LCE2B	O14633	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RRN3-205	ENST00000563559	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RRN3-205	ENST00000563559	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.86	□□□□□ -1.31
RRN3-205	ENST00000563559	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.77	□□□□□ -1.33
RRN3-205	ENST00000563559	USH2A	O75445	5202 aa		6.73	□□□□□ -1.33
RRN3-205	ENST00000563559	INE1	O15225	51 aa		6.71	□□□□□ -1.33
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RRN3-205	ENST00000563559	KMT2D	O14686	5537 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RRN3-205	ENST00000563559	SSPO	A2VEC9	5147 aa		6.44	□□□□□ -1.38
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.43	□□□□□ -1.38
RRN3-205	ENST00000563559	MT1E	P04732	61 aa		6.4	□□□□□ -1.39
RRN3-205	ENST00000563559	MT1L	Q93083	61 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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