RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNXBP22105 4242 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 CRIPTQ9P021 101 aa10.6□□□□□ -0.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSPG2P98160 4391 aa10.6□□□□□ -0.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.55□□□□□ -0.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP10-8P60410 259 aa10.54□□□□□ -0.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 ROMO1P60602 79 aa10.54□□□□□ -0.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 RYR3Q15413 4870 aa10.53□□□□□ -0.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.53□□□□□ -0.72
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RPS6KL1-216ENST00000557413 A0A0D9SG42 100 aa10.51□□□□□ -0.73
RPS6KL1-216ENST00000557413 XP32Q5T750 250 aa10.5□□□□□ -0.73
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYCBP2O75592 4640 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS6KL1-216ENST00000557413 H3BS24 57 aa10.42□□□□□ -0.74
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.16□□□□□ -0.78
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1HL1P0DM35 61 aa10.15□□□□□ -0.78
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RPS6KL1-216ENST00000557413 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.09□□□□□ -0.79
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRP2P98164 4655 aa10.08□□□□□ -0.8
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RPS6KL1-216ENST00000557413 R4GN34 69 aa9.79□□□□□ -0.84
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 NDUFAF8A1L188 74 aa9.72□□□□□ -0.85
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RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC17Q685J3 4493 aa9.64□□□□□ -0.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 A0A0A0MQY5 61 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 J3QL48 77 aa9.39□□□□□ -0.91
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RPS6KL1-216ENST00000557413 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.32□□□□□ -0.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.32□□□□□ -0.92
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RPS6KL1-216ENST00000557413 TNP1P09430 55 aa8.99□□□□□ -0.97
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RPS6KL1-216ENST00000557413 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.61□□□□□ -1.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 M0R2T5 61 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE3AQ5TA76 89 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 RNF213Q63HN8 5207 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1HP80294 61 aa8.48□□□□□ -1.05
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP10-10P60014 251 aa8.42□□□□□ -1.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT2AP02795 61 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.32□□□□□ -1.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.27□□□□□ -1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.26□□□□□ -1.09
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP10-5P60370 271 aa8.2□□□□□ -1.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1BP07438 61 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1XP80297 61 aa8.17□□□□□ -1.1
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP10-12P60413 245 aa8.09□□□□□ -1.11
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP12-3P60328 96 aa8.08□□□□□ -1.12
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.95□□□□□ -1.14
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.67□□□□□ -1.18
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RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE2BO14633 110 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 USH2AO75445 5202 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 KMT2DO14686 5537 aa7.54□□□□□ -1.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.36□□□□□ -1.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1LQ93083 61 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1EP04732 61 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 SSPOA2VEC9 5147 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.98□□□□□ -1.29
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