RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9-208ENST00000556007 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.33□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.33□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 ACACAQ13085 2346 aa-0.34□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.34□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.34□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 ABCA6Q8N139 1617 aa-0.35□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.35□□□□□ -2.46
TIMM9-208ENST00000556007 WT1-ASQ06250 92 aa-0.35□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.35□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 UTRNP46939 3433 aa-0.36□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 MT1AP04731 61 aa-0.36□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.36□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.36□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.37□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.37□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 FRYLO94915 3013 aa-0.37□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.37□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.38□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 LY75O60449 1722 aa-0.38□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 GLI2P10070 1586 aa-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 TRIOO75962 3097 aa-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.39□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 A0A087WWC5 75 aa-0.4□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
TIMM9-208ENST00000556007 MUC17Q685J3 4493 aa-0.41□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 ATMQ13315 3056 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 CDH23Q9H251 3354 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 FCER1GP30273 86 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.42□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.43□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.43□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.43□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.43□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.44□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 M0R1W7 72 aa-0.44□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 K7EMI3 77 aa-0.45□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 A0A1B0GUL6 1792 aa-0.45□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.46□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 TIAM1Q13009 1591 aa-0.46□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.47□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.47□□□□□ -2.48
TIMM9-208ENST00000556007 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.48□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 H3BUA1 57 aa-0.49□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.49□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.5□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 S100ZQ8WXG8 99 aa-0.5□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.51□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-0.51□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 NMES1Q9C002 83 aa-0.51□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-0.51□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-0.52□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 EEA1Q15075 1411 aa-0.52□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 IGIPA6NJ69 53 aa-0.52□□□□□ -2.49
TIMM9-208ENST00000556007 SERF2P84101 59 aa-0.54□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.56□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 CPS1P31327 1500 aa-0.56□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 MROH2AA6NES4 1674 aa-0.56□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.56□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-0.57□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.57□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.57□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.57□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 SMIM5Q71RC9 77 aa-0.58□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-0.58□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 PRXQ9BXM0 1461 aa-0.59□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-0.59□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
TIMM9-208ENST00000556007 TNP1P09430 55 aa-0.6□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.61□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.61□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.62□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.62□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 ABRACLQ9P1F3 81 aa-0.63□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 LMO7Q8WWI1 1683 aa-0.63□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 AGLP35573 1532 aa-0.64□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 H0YGX0 51 aa-0.65□□□□□ -2.51
TIMM9-208ENST00000556007 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-0.66□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 M0QY20 66 aa-0.66□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 KIF21BO75037 1637 aa-0.67□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-0.68□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 DMDP11532 3685 aa-0.68□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.69□□□□□ -2.52
TIMM9-208ENST00000556007 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms