RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555021.1

PAPOLA-211, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 4

Gene PAPOLA, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-211ENST00000555021 ACACBO00763 2458 aa-0.06□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 LAMA3Q16787 3333 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 H0YGX0 51 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 MT4P47944 62 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.07□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 MROH2AA6NES4 1674 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 SMIM5Q71RC9 77 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 ABRACLQ9P1F3 81 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 AGLP35573 1532 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 SYCP2Q9BX26 1530 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.08□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 M0QY20 66 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 DEFB131AP59861 70 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 DEFB1P60022 68 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.09□□□□□ -2.42
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1EP04732 61 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 ITPR1Q14643 2758 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.1□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.11□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 PLNP26678 52 aa-0.11□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-0.11□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1XP80297 61 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1LQ93083 61 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 RELNP78509 3460 aa-0.12□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CMC2Q9NRP2 79 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.13□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 A0A1B0GUL6 1792 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 LMO7Q8WWI1 1683 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 KIF21BO75037 1637 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 EP400Q96L91 3159 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MT2AP02795 61 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1MQ8N339 61 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 SMIM2Q9BVW6 85 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 IQGAP1P46940 1657 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 ABCC8Q09428 1581 aa-0.15□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.16□□□□□ -2.43
PAPOLA-211ENST00000555021 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.16□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-0.16□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.16□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.16□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 NFAT5O94916 1531 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 ITPR2Q14571 2701 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 MT1BP07438 61 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 TFF3Q07654 80 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 LEAP2Q969E1 77 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.17□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 TRPM2O94759 1503 aa-0.18□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.18□□□□□ -2.44
PAPOLA-211ENST00000555021 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms