RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540418.5

MDM1-210, Transcript of Mdm1 nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDM1, Length 2,507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1-210ENST00000540418 SNURFQ9Y675 71 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM1-210ENST00000540418 DMAC1Q96GE9 116 aa7□□□□□ -1.29
MDM1-210ENST00000540418 NDUFC1O43677 76 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM1-210ENST00000540418 C20orf197Q8N268 126 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM1-210ENST00000540418 COX7CP15954 63 aa6.94□□□□□ -1.3
MDM1-210ENST00000540418 ACYP2P14621 99 aa6.91□□□□□ -1.3
MDM1-210ENST00000540418 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.88□□□□□ -1.31
MDM1-210ENST00000540418 LCE2BO14633 110 aa6.87□□□□□ -1.31
MDM1-210ENST00000540418 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.85□□□□□ -1.31
MDM1-210ENST00000540418 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.85□□□□□ -1.31
MDM1-210ENST00000540418 H0YAA0 97 aa6.84□□□□□ -1.31
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.83□□□□□ -1.32
MDM1-210ENST00000540418 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.82□□□□□ -1.32
MDM1-210ENST00000540418 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.77□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.77□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.76□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.76□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.76□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 H7BZZ5 65 aa6.76□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 CRIPTQ9P021 101 aa6.75□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.73□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 USH2AO75445 5202 aa6.73□□□□□ -1.33
MDM1-210ENST00000540418 CCDC179H3BU77 68 aa6.7□□□□□ -1.34
MDM1-210ENST00000540418 COA5Q86WW8 74 aa6.66□□□□□ -1.34
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
MDM1-210ENST00000540418 P0C880 135 aa6.65□□□□□ -1.34
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.64□□□□□ -1.35
MDM1-210ENST00000540418 Q5VV11 94 aa6.61□□□□□ -1.35
MDM1-210ENST00000540418 SSPOA2VEC9 5147 aa6.6□□□□□ -1.35
MDM1-210ENST00000540418 MT1BP07438 61 aa6.58□□□□□ -1.36
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.58□□□□□ -1.36
MDM1-210ENST00000540418 R4GN34 69 aa6.57□□□□□ -1.36
MDM1-210ENST00000540418 M0QZ58 72 aa6.53□□□□□ -1.36
MDM1-210ENST00000540418 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MDM1-210ENST00000540418 TMEM258P61165 79 aa6.47□□□□□ -1.37
MDM1-210ENST00000540418 SEC61GP60059 68 aa6.45□□□□□ -1.38
MDM1-210ENST00000540418 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
MDM1-210ENST00000540418 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.43□□□□□ -1.38
MDM1-210ENST00000540418 LINC01554Q52M75 96 aa6.42□□□□□ -1.38
MDM1-210ENST00000540418 PLAC4Q8WY50 150 aa6.4□□□□□ -1.38
MDM1-210ENST00000540418 A6NN06 94 aa6.4□□□□□ -1.39
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP10-5P60370 271 aa6.38□□□□□ -1.39
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.33□□□□□ -1.4
MDM1-210ENST00000540418 A0A1B0GU69 56 aa6.33□□□□□ -1.4
MDM1-210ENST00000540418 A0A1B0GU33 70 aa6.31□□□□□ -1.4
MDM1-210ENST00000540418 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.27□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 PCP4P48539 62 aa6.25□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 MT1XP80297 61 aa6.25□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.24□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 PRR15LQ9BU68 103 aa6.24□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.23□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.18□□□□□ -1.42
MDM1-210ENST00000540418 A0A0D9SG42 100 aa6.18□□□□□ -1.42
MDM1-210ENST00000540418 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.13□□□□□ -1.43
MDM1-210ENST00000540418 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.09□□□□□ -1.43
MDM1-210ENST00000540418 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.08□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 V9GYY9 64 aa6.07□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP12-1P59990 96 aa6.07□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 A8MU10 97 aa6.06□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP12-2P59991 146 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 Q1T7F1 81 aa6.05□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 UQCR11O14957 56 aa6.03□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MDM1-210ENST00000540418 PSPHP1O15172 72 aa5.98□□□□□ -1.45
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP10-12P60413 245 aa5.95□□□□□ -1.46
MDM1-210ENST00000540418 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP5-9P26371 169 aa5.9□□□□□ -1.46
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.88□□□□□ -1.47
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.88□□□□□ -1.47
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.88□□□□□ -1.47
MDM1-210ENST00000540418 KMT2DO14686 5537 aa5.85□□□□□ -1.47
MDM1-210ENST00000540418 A6NED7 52 aa5.8□□□□□ -1.48
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.79□□□□□ -1.48
MDM1-210ENST00000540418 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.78□□□□□ -1.48
MDM1-210ENST00000540418 K7ERS5 55 aa5.76□□□□□ -1.49
MDM1-210ENST00000540418 TNP1P09430 55 aa5.71□□□□□ -1.5
MDM1-210ENST00000540418 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.69□□□□□ -1.5
MDM1-210ENST00000540418 NEBP20929 6669 aa5.65□□□□□ -1.5
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2EP22531 72 aa5.64□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2BP35325 72 aa5.64□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2AP35326 72 aa5.64□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.62□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.6□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 MDN1Q9NU22 5596 aa5.6□□□□□ -1.51
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.58□□□□□ -1.52
MDM1-210ENST00000540418 LCE3AQ5TA76 89 aa5.55□□□□□ -1.52
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.54□□□□□ -1.52
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.53□□□□□ -1.52
MDM1-210ENST00000540418 MT1EP04732 61 aa5.52□□□□□ -1.53
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.45□□□□□ -1.54
MDM1-210ENST00000540418 SPRR2DP22532 72 aa5.45□□□□□ -1.54
MDM1-210ENST00000540418 ROMO1P60602 79 aa5.42□□□□□ -1.54
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.41□□□□□ -1.54
MDM1-210ENST00000540418 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.41□□□□□ -1.54
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