RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532564.6

GMDS-AS1-210, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 1,436 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-210ENST00000532564 OCR1Q9BZK8 76 aa4.47□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.46□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC17Q685J3 4493 aa4.46□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.46□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 H0Y9P7 68 aa4.46□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.45□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MP68P56378 58 aa4.43□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C5orf47Q569G3 176 aa4.42□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SERP2Q8N6R1 65 aa4.42□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.42□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LINC00208Q96KT6 92 aa4.41□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RNF213Q63HN8 5207 aa4.41□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPINK7P58062 85 aa4.4□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.4□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.39□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.39□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.38□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 COX7CP15954 63 aa4.38□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 H3BPC8 53 aa4.37□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C20orf197Q8N268 126 aa4.37□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SNURFQ9Y675 71 aa4.37□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.36□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A0A0U1RQV1 116 aa4.35□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KLKP1Q107X0 134 aa4.33□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CCDC179H3BU77 68 aa4.32□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 HRES1P13985 223 aa4.32□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.31□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAM236CP0DP71 79 aa4.31□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C4orf26Q17RF5 130 aa4.31□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.3□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.3□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.29□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.29□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC2Q02817 5179 aa4.28□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.27□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NDUFC1O43677 76 aa4.25□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-210ENST00000532564 H7BZZ5 65 aa4.22□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.22□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.21□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-210ENST00000532564 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.21□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.2□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.19□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NDUFAF8A1L188 74 aa4.19□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A8MUN3 132 aa4.19□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 DMAC1Q96GE9 116 aa4.19□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 S4R3F8 94 aa4.17□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ACYP2P14621 99 aa4.16□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRAC1Q96KF2 57 aa4.15□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TMEM258P61165 79 aa4.14□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 M0R2T5 61 aa4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1HP80294 61 aa4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCA10Q71F78 164 aa4.13□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 COA5Q86WW8 74 aa4.11□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CSAG1Q6PB30 78 aa4.07□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.05□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.03□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.03□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.95□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT2AP02795 61 aa3.94□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP10-10P60014 251 aa3.93□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 H0YAA0 97 aa3.92□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SEC61GP60059 68 aa3.92□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1FP04733 61 aa3.91□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.91□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 P0C880 135 aa3.9□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.89□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A0A1B0GU69 56 aa3.89□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-9P26371 169 aa3.88□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.88□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRR15LQ9BU68 103 aa3.87□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 V9GYY9 64 aa3.86□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 Q1T7F1 81 aa3.84□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PSPHP1O15172 72 aa3.83□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 R4GN34 69 aa3.83□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 M0QZ58 72 aa3.82□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CRIPTQ9P021 101 aa3.82□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A0A1B0GU33 70 aa3.81□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP12-2P59991 146 aa3.81□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LINC01554Q52M75 96 aa3.78□□□□□ -1.8
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.77□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.77□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.77□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 Q5VV11 94 aa3.76□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A8MU10 97 aa3.75□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A0A0D9SG42 100 aa3.73□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 UQCR11O14957 56 aa3.73□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A6NED7 52 aa3.71□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.71□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.71□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 USH2AO75445 5202 aa3.7□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.7□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE3AQ5TA76 89 aa3.7□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.69□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRO0628Q9UI54 55 aa3.69□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1BP07438 61 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.7 ms