RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 TNXBP22105 4242 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 H3BS24 57 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 HSPG2P98160 4391 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-8P60410 259 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 S4R3F8 94 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0D9SG42 100 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 XP32Q5T750 250 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 RYR2Q92736 4967 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 P0C880 135 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRK-217ENST00000524534 TPRXLQ17RH7 258 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRK-217ENST00000524534 MYCBP2O75592 4640 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-217ENST00000524534 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP12-2P59991 146 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-217ENST00000524534 Q5VSD8 79 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-217ENST00000524534 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-217ENST00000524534 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP12-1P59990 96 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-217ENST00000524534 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-217ENST00000524534 MT1HL1P0DM35 61 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 LPAP08519 4548 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 M0QZ58 72 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 RYR1P21817 5038 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-217ENST00000524534 LRP2P98164 4655 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-217ENST00000524534 J3QL48 77 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-217ENST00000524534 RYR3Q15413 4870 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFAF8A1L188 74 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-217ENST00000524534 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-217ENST00000524534 R4GN34 69 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRK-217ENST00000524534 MUC17Q685J3 4493 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-217ENST00000524534 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-217ENST00000524534 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-217ENST00000524534 PLAC4Q8WY50 150 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-217ENST00000524534 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-217ENST00000524534 PP632Q6XCG6 107 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRK-217ENST00000524534 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRK-217ENST00000524534 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-217ENST00000524534 LUZP6Q538Z0 58 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-217ENST00000524534 HERC1Q15751 4861 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-217ENST00000524534 HERC2O95714 4834 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-217ENST00000524534 TNP1P09430 55 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-217ENST00000524534 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-217ENST00000524534 MUC2Q02817 5179 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRK-217ENST00000524534 LCE2BO14633 110 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-217ENST00000524534 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0A0MQY5 61 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-217ENST00000524534 LCE2CQ5TA81 110 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-217ENST00000524534 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-217ENST00000524534 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-217ENST00000524534 LCE3AQ5TA76 89 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-217ENST00000524534 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-217ENST00000524534 MT1HP80294 61 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-217ENST00000524534 M0R2T5 61 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-217ENST00000524534 MT1FP04733 61 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-217ENST00000524534 MT2AP02795 61 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-10P60014 251 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRK-217ENST00000524534 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-5P60370 271 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRK-217ENST00000524534 MT1BP07438 61 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-217ENST00000524534 MT1XP80297 61 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-217ENST00000524534 RNF213Q63HN8 5207 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP12-3P60328 96 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-12P60413 245 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-217ENST00000524534 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRK-217ENST00000524534 INE1O15225 51 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRK-217ENST00000524534 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-217ENST00000524534 KMT2DO14686 5537 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 USH2AO75445 5202 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-217ENST00000524534 MT1LQ93083 61 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-217ENST00000524534 MT1EP04732 61 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-217ENST00000524534 SSPOA2VEC9 5147 aa3.8□□□□□ -1.8
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