RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 KLKP1Q107X0 134 aa8.88□□□□□ -0.99
PITX1-204ENST00000504936 IMUPQ9GZP8 106 aa8.87□□□□□ -0.99
PITX1-204ENST00000504936 H3BPC8 53 aa8.84□□□□□ -0.99
PITX1-204ENST00000504936 A8MUN3 132 aa8.81□□□□□ -1
PITX1-204ENST00000504936 SSPOA2VEC9 5147 aa8.81□□□□□ -1
PITX1-204ENST00000504936 NDUFC1O43677 76 aa8.78□□□□□ -1
PITX1-204ENST00000504936 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.74□□□□□ -1.01
PITX1-204ENST00000504936 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.72□□□□□ -1.01
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.7□□□□□ -1.02
PITX1-204ENST00000504936 DMAC1Q96GE9 116 aa8.63□□□□□ -1.03
PITX1-204ENST00000504936 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PITX1-204ENST00000504936 SNURFQ9Y675 71 aa8.57□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.56□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.56□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.55□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 H0YAA0 97 aa8.54□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 Q5VV11 94 aa8.53□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.53□□□□□ -1.04
PITX1-204ENST00000504936 CRIPTQ9P021 101 aa8.52□□□□□ -1.05
PITX1-204ENST00000504936 ACYP2P14621 99 aa8.5□□□□□ -1.05
PITX1-204ENST00000504936 C20orf197Q8N268 126 aa8.5□□□□□ -1.05
PITX1-204ENST00000504936 SERP2Q8N6R1 65 aa8.5□□□□□ -1.05
PITX1-204ENST00000504936 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.44□□□□□ -1.06
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.44□□□□□ -1.06
PITX1-204ENST00000504936 MT1BP07438 61 aa8.43□□□□□ -1.06
PITX1-204ENST00000504936 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.4□□□□□ -1.06
PITX1-204ENST00000504936 A6NN06 94 aa8.35□□□□□ -1.07
PITX1-204ENST00000504936 P0C880 135 aa8.35□□□□□ -1.07
PITX1-204ENST00000504936 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.35□□□□□ -1.07
PITX1-204ENST00000504936 R4GN34 69 aa8.34□□□□□ -1.07
PITX1-204ENST00000504936 M0QZ58 72 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX1-204ENST00000504936 COX7CP15954 63 aa8.3□□□□□ -1.08
PITX1-204ENST00000504936 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PITX1-204ENST00000504936 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PITX1-204ENST00000504936 LINC01554Q52M75 96 aa8.21□□□□□ -1.1
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP10-5P60370 271 aa8.2□□□□□ -1.1
PITX1-204ENST00000504936 PLAC4Q8WY50 150 aa8.19□□□□□ -1.1
PITX1-204ENST00000504936 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.18□□□□□ -1.1
PITX1-204ENST00000504936 COA5Q86WW8 74 aa8.17□□□□□ -1.1
PITX1-204ENST00000504936 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.11□□□□□ -1.11
PITX1-204ENST00000504936 H7BZZ5 65 aa8.1□□□□□ -1.11
PITX1-204ENST00000504936 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.07□□□□□ -1.12
PITX1-204ENST00000504936 SEC61GP60059 68 aa8□□□□□ -1.13
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.98□□□□□ -1.13
PITX1-204ENST00000504936 CCDC179H3BU77 68 aa7.97□□□□□ -1.13
PITX1-204ENST00000504936 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.97□□□□□ -1.13
PITX1-204ENST00000504936 MT1XP80297 61 aa7.96□□□□□ -1.14
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.87□□□□□ -1.15
PITX1-204ENST00000504936 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PITX1-204ENST00000504936 A0A0D9SG42 100 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 A0A1B0GU33 70 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 A0A1B0GU69 56 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 H3BS24 57 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 KMT2DO14686 5537 aa7.77□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.75□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 NEBP20929 6669 aa7.75□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.74□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.73□□□□□ -1.17
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP12-2P59991 146 aa7.71□□□□□ -1.18
PITX1-204ENST00000504936 TMEM258P61165 79 aa7.69□□□□□ -1.18
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP5-9P26371 169 aa7.67□□□□□ -1.18
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.67□□□□□ -1.18
PITX1-204ENST00000504936 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.65□□□□□ -1.18
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.63□□□□□ -1.19
PITX1-204ENST00000504936 PRR15LQ9BU68 103 aa7.63□□□□□ -1.19
PITX1-204ENST00000504936 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.58□□□□□ -1.2
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.56□□□□□ -1.2
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.56□□□□□ -1.2
PITX1-204ENST00000504936 MDN1Q9NU22 5596 aa7.55□□□□□ -1.2
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP10-12P60413 245 aa7.54□□□□□ -1.2
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP12-1P59990 96 aa7.51□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.51□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 A8MU10 97 aa7.5□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.48□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2EP22531 72 aa7.47□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2BP35325 72 aa7.47□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2AP35326 72 aa7.47□□□□□ -1.21
PITX1-204ENST00000504936 UQCR11O14957 56 aa7.33□□□□□ -1.24
PITX1-204ENST00000504936 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.3□□□□□ -1.24
PITX1-204ENST00000504936 V9GYY9 64 aa7.25□□□□□ -1.25
PITX1-204ENST00000504936 SPRR2DP22532 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PITX1-204ENST00000504936 PSPHP1O15172 72 aa7.21□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.18□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.18□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 PCP4P48539 62 aa7.16□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 TNP1P09430 55 aa7.15□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 Q1T7F1 81 aa7.15□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.15□□□□□ -1.26
PITX1-204ENST00000504936 K7ERS5 55 aa7.09□□□□□ -1.27
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.09□□□□□ -1.27
PITX1-204ENST00000504936 MT1EP04732 61 aa7.05□□□□□ -1.28
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.04□□□□□ -1.28
PITX1-204ENST00000504936 A6NED7 52 aa7.01□□□□□ -1.29
PITX1-204ENST00000504936 LCE3AQ5TA76 89 aa7.01□□□□□ -1.29
PITX1-204ENST00000504936 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.98□□□□□ -1.29
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.98□□□□□ -1.29
PITX1-204ENST00000504936 LCE3BQ5TA77 95 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms