RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00313P59037 77 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 DMAC1Q96GE9 116 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 Q5VSD8 79 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 Q5W150 140 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 LCA10Q71F78 164 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 SEC61GP60059 68 aa5.46□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2-30P06310 120 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-8P60410 259 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK1P00995 79 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 A6NN06 94 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 TNXBP22105 4242 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 A8MU10 97 aa5.4□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.4□□□□□ -1.54
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK7P58062 85 aa5.4□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.4□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GU69 56 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 MT1HL1P0DM35 61 aa5.36□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.34□□□□□ -1.55
POLR1A-208ENST00000486964 UQCR11O14957 56 aa5.31□□□□□ -1.56
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.31□□□□□ -1.56
POLR1A-208ENST00000486964 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.31□□□□□ -1.56
POLR1A-208ENST00000486964 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.28□□□□□ -1.56
POLR1A-208ENST00000486964 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.28□□□□□ -1.56
POLR1A-208ENST00000486964 RNF213Q63HN8 5207 aa5.22□□□□□ -1.57
POLR1A-208ENST00000486964 LRP2P98164 4655 aa5.2□□□□□ -1.58
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.2□□□□□ -1.58
POLR1A-208ENST00000486964 A8MUU9 505 aa5.19□□□□□ -1.58
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.18□□□□□ -1.58
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf92A6NGG3 77 aa5.13□□□□□ -1.59
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0A0MQY5 61 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 TPRXLQ17RH7 258 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 PRAC1Q96KF2 57 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GU33 70 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01554Q52M75 96 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 K7ERS5 55 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 H0YAA0 97 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1A-208ENST00000486964 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.02□□□□□ -1.61
POLR1A-208ENST00000486964 LCE4AQ5TA78 99 aa5□□□□□ -1.61
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5□□□□□ -1.61
POLR1A-208ENST00000486964 LPAP08519 4548 aa4.98□□□□□ -1.61
POLR1A-208ENST00000486964 CSAG1Q6PB30 78 aa4.97□□□□□ -1.61
POLR1A-208ENST00000486964 MUC17Q685J3 4493 aa4.94□□□□□ -1.62
POLR1A-208ENST00000486964 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.92□□□□□ -1.62
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.91□□□□□ -1.62
POLR1A-208ENST00000486964 MUC2Q02817 5179 aa4.89□□□□□ -1.63
POLR1A-208ENST00000486964 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
POLR1A-208ENST00000486964 S4R3F8 94 aa4.88□□□□□ -1.63
POLR1A-208ENST00000486964 ROMO1P60602 79 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.77□□□□□ -1.65
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.76□□□□□ -1.65
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.73□□□□□ -1.65
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0D9SG42 100 aa4.72□□□□□ -1.65
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.72□□□□□ -1.65
POLR1A-208ENST00000486964 M0QZ58 72 aa4.71□□□□□ -1.66
POLR1A-208ENST00000486964 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1A-208ENST00000486964 P0C880 135 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1A-208ENST00000486964 CRIPTQ9P021 101 aa4.65□□□□□ -1.66
POLR1A-208ENST00000486964 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP12-1P59990 96 aa4.61□□□□□ -1.67
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP12-2P59991 146 aa4.61□□□□□ -1.67
POLR1A-208ENST00000486964 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.58□□□□□ -1.68
POLR1A-208ENST00000486964 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.57□□□□□ -1.68
POLR1A-208ENST00000486964 R4GN34 69 aa4.52□□□□□ -1.69
POLR1A-208ENST00000486964 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.5□□□□□ -1.69
POLR1A-208ENST00000486964 MT1HP80294 61 aa4.48□□□□□ -1.69
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.45□□□□□ -1.7
POLR1A-208ENST00000486964 PP632Q6XCG6 107 aa4.38□□□□□ -1.71
POLR1A-208ENST00000486964 M0R2T5 61 aa4.34□□□□□ -1.71
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFAF8A1L188 74 aa4.32□□□□□ -1.72
POLR1A-208ENST00000486964 MT2AP02795 61 aa4.31□□□□□ -1.72
POLR1A-208ENST00000486964 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.29□□□□□ -1.72
POLR1A-208ENST00000486964 MT1FP04733 61 aa4.29□□□□□ -1.72
POLR1A-208ENST00000486964 PLAC4Q8WY50 150 aa4.26□□□□□ -1.73
POLR1A-208ENST00000486964 SSPOA2VEC9 5147 aa4.26□□□□□ -1.73
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.25□□□□□ -1.73
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-10P60014 251 aa4.22□□□□□ -1.73
POLR1A-208ENST00000486964 USH2AO75445 5202 aa4.21□□□□□ -1.74
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
POLR1A-208ENST00000486964 TNP1P09430 55 aa4.18□□□□□ -1.74
POLR1A-208ENST00000486964 LUZP6Q538Z0 58 aa4.17□□□□□ -1.74
POLR1A-208ENST00000486964 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.15□□□□□ -1.74
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