RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SSPOA2VEC9 5147 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP4-209ENST00000484097 KLKP1Q107X0 134 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MUN3 132 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP4-209ENST00000484097 H3BPC8 53 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFC1O43677 76 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-209ENST00000484097 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 SERP2Q8N6R1 65 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 Q5VV11 94 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 CRIPTQ9P021 101 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 SNURFQ9Y675 71 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YAA0 97 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 C20orf197Q8N268 126 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 DMAC1Q96GE9 116 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-209ENST00000484097 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1BP07438 61 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 COX7CP15954 63 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP4-209ENST00000484097 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-209ENST00000484097 A6NN06 94 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-209ENST00000484097 ACYP2P14621 99 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-209ENST00000484097 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-209ENST00000484097 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP10-5P60370 271 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 R4GN34 69 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 P0C880 135 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC179H3BU77 68 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-209ENST00000484097 H7BZZ5 65 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-209ENST00000484097 M0QZ58 72 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-209ENST00000484097 PLAC4Q8WY50 150 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP4-209ENST00000484097 COA5Q86WW8 74 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01554Q52M75 96 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP4-209ENST00000484097 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.18□□□□□ -1.1
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SH3BP4-209ENST00000484097 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM258P61165 79 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC61GP60059 68 aa7.95□□□□□ -1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP5-9P26371 169 aa7.9□□□□□ -1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP12-2P59991 146 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.85□□□□□ -1.15
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SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.77□□□□□ -1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GU69 56 aa7.76□□□□□ -1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.76□□□□□ -1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GU33 70 aa7.74□□□□□ -1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.74□□□□□ -1.17
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SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0D9SG42 100 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP10-12P60413 245 aa7.67□□□□□ -1.18
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SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.64□□□□□ -1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR2BP35325 72 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR2AP35326 72 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MDN1Q9NU22 5596 aa7.54□□□□□ -1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-209ENST00000484097 V9GYY9 64 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MU10 97 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 Q1T7F1 81 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 PSPHP1O15172 72 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP4-209ENST00000484097 UQCR11O14957 56 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRR2DP22532 72 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-209ENST00000484097 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 A6NED7 52 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 TNP1P09430 55 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 MT1EP04732 61 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 LCE3BQ5TA77 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 K7ERS5 55 aa7.06□□□□□ -1.28
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