RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 KLKP1Q107X0 134 aa9.57□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 A8MUN3 132 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 H3BPC8 53 aa9.52□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 IMUPQ9GZP8 106 aa9.52□□□□□ -0.88
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-208ENST00000481121 MT-ATP8P03928 68 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-208ENST00000481121 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NELFE-208ENST00000481121 NDUFC1O43677 76 aa9.47□□□□□ -0.89
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.45□□□□□ -0.9
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.37□□□□□ -0.91
NELFE-208ENST00000481121 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.36□□□□□ -0.91
NELFE-208ENST00000481121 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.34□□□□□ -0.91
NELFE-208ENST00000481121 H0YAA0 97 aa9.33□□□□□ -0.92
NELFE-208ENST00000481121 DMAC1Q96GE9 116 aa9.33□□□□□ -0.92
NELFE-208ENST00000481121 CRIPTQ9P021 101 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-208ENST00000481121 Q5VV11 94 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.28□□□□□ -0.92
NELFE-208ENST00000481121 MT1BP07438 61 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-208ENST00000481121 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-208ENST00000481121 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
NELFE-208ENST00000481121 ACYP2P14621 99 aa9.14□□□□□ -0.95
NELFE-208ENST00000481121 SNURFQ9Y675 71 aa9.14□□□□□ -0.95
NELFE-208ENST00000481121 A6NN06 94 aa9.11□□□□□ -0.95
NELFE-208ENST00000481121 SERP2Q8N6R1 65 aa9.09□□□□□ -0.95
NELFE-208ENST00000481121 C20orf197Q8N268 126 aa9.08□□□□□ -0.96
NELFE-208ENST00000481121 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NELFE-208ENST00000481121 P0C880 135 aa9.05□□□□□ -0.96
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-5P60370 271 aa9.02□□□□□ -0.97
NELFE-208ENST00000481121 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.01□□□□□ -0.97
NELFE-208ENST00000481121 R4GN34 69 aa9.01□□□□□ -0.97
NELFE-208ENST00000481121 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9□□□□□ -0.97
NELFE-208ENST00000481121 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.99□□□□□ -0.97
NELFE-208ENST00000481121 M0QZ58 72 aa8.95□□□□□ -0.98
NELFE-208ENST00000481121 PLAC4Q8WY50 150 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-208ENST00000481121 COX7CP15954 63 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-208ENST00000481121 SVIPQ8NHG7 77 aa8.83□□□□□ -1
NELFE-208ENST00000481121 LINC01554Q52M75 96 aa8.81□□□□□ -1
NELFE-208ENST00000481121 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.8□□□□□ -1
NELFE-208ENST00000481121 MT1XP80297 61 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-208ENST00000481121 COA5Q86WW8 74 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-208ENST00000481121 H7BZZ5 65 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-208ENST00000481121 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFE-208ENST00000481121 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.65□□□□□ -1.02
NELFE-208ENST00000481121 SEC61GP60059 68 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-9P26371 169 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-208ENST00000481121 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-208ENST00000481121 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-208ENST00000481121 KMT2DO14686 5537 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP12-2P59991 146 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-208ENST00000481121 CCDC179H3BU77 68 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-208ENST00000481121 NEBP20929 6669 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GU33 70 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
NELFE-208ENST00000481121 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 MDN1Q9NU22 5596 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 A0A0D9SG42 100 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GU69 56 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-12P60413 245 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2EP22531 72 aa8.19□□□□□ -1.1
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2BP35325 72 aa8.19□□□□□ -1.1
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2AP35326 72 aa8.19□□□□□ -1.1
NELFE-208ENST00000481121 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.19□□□□□ -1.1
NELFE-208ENST00000481121 TMEM258P61165 79 aa8.17□□□□□ -1.1
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP12-1P59990 96 aa8.13□□□□□ -1.11
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.13□□□□□ -1.11
NELFE-208ENST00000481121 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.12□□□□□ -1.11
NELFE-208ENST00000481121 PRR15LQ9BU68 103 aa8.12□□□□□ -1.11
NELFE-208ENST00000481121 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-208ENST00000481121 A8MU10 97 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-208ENST00000481121 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.94□□□□□ -1.14
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.94□□□□□ -1.14
NELFE-208ENST00000481121 SPRR2DP22532 72 aa7.91□□□□□ -1.14
NELFE-208ENST00000481121 UQCR11O14957 56 aa7.83□□□□□ -1.16
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.8□□□□□ -1.16
NELFE-208ENST00000481121 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.74□□□□□ -1.17
NELFE-208ENST00000481121 MT1EP04732 61 aa7.73□□□□□ -1.17
NELFE-208ENST00000481121 TNP1P09430 55 aa7.72□□□□□ -1.17
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.7□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.7□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 V9GYY9 64 aa7.7□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.67□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 LCE3BQ5TA77 95 aa7.67□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.66□□□□□ -1.18
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.63□□□□□ -1.19
NELFE-208ENST00000481121 PSPHP1O15172 72 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-208ENST00000481121 Q1T7F1 81 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-208ENST00000481121 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.62□□□□□ -1.19
NELFE-208ENST00000481121 LCE3AQ5TA76 89 aa7.6□□□□□ -1.19
NELFE-208ENST00000481121 K7ERS5 55 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.2 ms