RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.76■■■■■ 5.72
NELFE-208ENST00000481121 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.32■■■■■ 4.84
NELFE-208ENST00000481121 ABCC9O60706 1549 aa44.25■■■■■ 4.67
NELFE-208ENST00000481121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.61■■■■■ 4.41
NELFE-208ENST00000481121 NACADO15069 1562 aa42.51■■■■■ 4.4
NELFE-208ENST00000481121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.33■■■■■ 4.37
NELFE-208ENST00000481121 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
NELFE-208ENST00000481121 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.21■■■■■ 4.35
NELFE-208ENST00000481121 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.02■■■■■ 4.32
NELFE-208ENST00000481121 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.79■■■■■ 4.28
NELFE-208ENST00000481121 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.3■■■■■ 4.2
NELFE-208ENST00000481121 SCRIBQ14160 1630 aa41.29■■■■■ 4.2
NELFE-208ENST00000481121 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
NELFE-208ENST00000481121 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.87■■■■■ 4.13
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.52■■■■■ 4.08
NELFE-208ENST00000481121 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
NELFE-208ENST00000481121 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.09■■■■■ 4.01
NELFE-208ENST00000481121 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.76■■■■□ 3.96
NELFE-208ENST00000481121 SMARCA4P51532 1647 aa39.48■■■■□ 3.91
NELFE-208ENST00000481121 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
NELFE-208ENST00000481121 SMARCA2P51531 1590 aa39.2■■■■□ 3.87
NELFE-208ENST00000481121 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.18■■■■□ 3.86
NELFE-208ENST00000481121 NCAPD3P42695 1498 aa39.15■■■■□ 3.86
NELFE-208ENST00000481121 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.12■■■■□ 3.85
NELFE-208ENST00000481121 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.07■■■■□ 3.85
NELFE-208ENST00000481121 HMGXB3Q12766 1538 aa39.05■■■■□ 3.84
NELFE-208ENST00000481121 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
NELFE-208ENST00000481121 WIZO95785 1651 aa38.77■■■■□ 3.8
NELFE-208ENST00000481121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
NELFE-208ENST00000481121 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
NELFE-208ENST00000481121 NESP48681 1621 aa38.27■■■■□ 3.72
NELFE-208ENST00000481121 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.25■■■■□ 3.71
NELFE-208ENST00000481121 ERCC6Q03468 1493 aa38.17■■■■□ 3.7
NELFE-208ENST00000481121 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.99■■■■□ 3.67
NELFE-208ENST00000481121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.97■■■■□ 3.67
NELFE-208ENST00000481121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.9■■■■□ 3.66
NELFE-208ENST00000481121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
NELFE-208ENST00000481121 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.8■■■■□ 3.64
NELFE-208ENST00000481121 CUX2O14529 1486 aa37.79■■■■□ 3.64
NELFE-208ENST00000481121 CFTRP13569 1480 aa37.79■■■■□ 3.64
NELFE-208ENST00000481121 PRDM2Q13029 1718 aa37.76■■■■□ 3.63
NELFE-208ENST00000481121 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.62■■■■□ 3.61
NELFE-208ENST00000481121 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.61■■■■□ 3.61
NELFE-208ENST00000481121 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.55■■■■□ 3.6
NELFE-208ENST00000481121 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
NELFE-208ENST00000481121 WDR62O43379 1518 aa37.47■■■■□ 3.59
NELFE-208ENST00000481121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
NELFE-208ENST00000481121 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.02■■■■□ 3.52
NELFE-208ENST00000481121 TOPBP1Q92547 1522 aa37.02■■■■□ 3.52
NELFE-208ENST00000481121 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
NELFE-208ENST00000481121 IFT140Q96RY7 1462 aa36.79■■■■□ 3.48
NELFE-208ENST00000481121 CUX1P39880 1505 aa36.72■■■■□ 3.47
NELFE-208ENST00000481121 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
NELFE-208ENST00000481121 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
NELFE-208ENST00000481121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
NELFE-208ENST00000481121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.61■■■■□ 3.45
NELFE-208ENST00000481121 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.57■■■■□ 3.44
NELFE-208ENST00000481121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.5■■■■□ 3.43
NELFE-208ENST00000481121 SOGA1O94964 1423 aa36.49■■■■□ 3.43
NELFE-208ENST00000481121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.48■■■■□ 3.43
NELFE-208ENST00000481121 WDR97A6NE52 1622 aa36.44■■■■□ 3.42
NELFE-208ENST00000481121 TOP2BQ02880 1626 aa36.43■■■■□ 3.42
NELFE-208ENST00000481121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
NELFE-208ENST00000481121 SYNJ1O43426 1573 aa36.42■■■■□ 3.42
NELFE-208ENST00000481121 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.411e-10■■■■□ 20.9
NELFE-208ENST00000481121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
NELFE-208ENST00000481121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.24■■■■□ 3.39
NELFE-208ENST00000481121 PBRM1Q86U86 1689 aa36.22■■■■□ 3.39
NELFE-208ENST00000481121 CHD1O14646 1710 aa36.19■■■■□ 3.38
NELFE-208ENST00000481121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.18■■■■□ 3.38
NELFE-208ENST00000481121 GRIN2BQ13224 1484 aa36.11■■■■□ 3.37
NELFE-208ENST00000481121 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.11■■■■□ 3.37
NELFE-208ENST00000481121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.1■■■■□ 3.37
NELFE-208ENST00000481121 OSCARQ8IYS5 282 aa36.09■■■■□ 3.37
NELFE-208ENST00000481121 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
NELFE-208ENST00000481121 FBLN2P98095 1184 aa35.93■■■■□ 3.34
NELFE-208ENST00000481121 SYNJ2O15056 1496 aa35.9■■■■□ 3.34
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS12P58397 1594 aa35.84■■■■□ 3.33
NELFE-208ENST00000481121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
NELFE-208ENST00000481121 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
NELFE-208ENST00000481121 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
NELFE-208ENST00000481121 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
NELFE-208ENST00000481121 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
NELFE-208ENST00000481121 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.7■■■■□ 3.31
NELFE-208ENST00000481121 GRIN2AQ12879 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
NELFE-208ENST00000481121 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.67■■■■□ 3.3
NELFE-208ENST00000481121 KIF27Q86VH2 1401 aa35.67■■■■□ 3.3
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF11O15085 1522 aa35.64■■■■□ 3.3
NELFE-208ENST00000481121 CUL7Q14999 1698 aa35.58■■■■□ 3.29
NELFE-208ENST00000481121 CEP170Q5SW79 1584 aa35.54■■■■□ 3.28
NELFE-208ENST00000481121 NUP160Q12769 1436 aa35.48■■■■□ 3.27
NELFE-208ENST00000481121 IGF1RP08069 1367 aa35.45■■■■□ 3.27
NELFE-208ENST00000481121 TRIM41Q8WV44 630 aa35.45■■■■□ 3.27
NELFE-208ENST00000481121 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.33■■■■□ 3.25
NELFE-208ENST00000481121 ARAP1Q96P48 1450 aa35.33■■■■□ 3.25
NELFE-208ENST00000481121 SHROOM2Q13796 1616 aa35.32■■■■□ 3.24
NELFE-208ENST00000481121 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.27■■■■□ 3.24
NELFE-208ENST00000481121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.19■■■■□ 3.22
NELFE-208ENST00000481121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.18■■■■□ 3.22
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