RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 DMAC1Q96GE9 116 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-210ENST00000477812 MT2AP02795 61 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-210ENST00000477812 H7BZZ5 65 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-210ENST00000477812 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-210ENST00000477812 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-210ENST00000477812 MT1FP04733 61 aa9.43□□□□□ -0.9
ACTB-210ENST00000477812 CSAG1Q6PB30 78 aa9.43□□□□□ -0.9
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-210ENST00000477812 TMEM258P61165 79 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-210ENST00000477812 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ACTB-210ENST00000477812 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ACTB-210ENST00000477812 ACYP2P14621 99 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP10-10P60014 251 aa9.33□□□□□ -0.92
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-210ENST00000477812 H0YAA0 97 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-210ENST00000477812 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-210ENST00000477812 COA5Q86WW8 74 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-210ENST00000477812 LCE2BO14633 110 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTB-210ENST00000477812 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTB-210ENST00000477812 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTB-210ENST00000477812 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-210ENST00000477812 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.07□□□□□ -0.96
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.04□□□□□ -0.96
ACTB-210ENST00000477812 USH2AO75445 5202 aa9.03□□□□□ -0.96
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-210ENST00000477812 P0C880 135 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-210ENST00000477812 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-210ENST00000477812 CRIPTQ9P021 101 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-210ENST00000477812 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-210ENST00000477812 SSPOA2VEC9 5147 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-210ENST00000477812 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.82□□□□□ -1
ACTB-210ENST00000477812 MT1BP07438 61 aa8.81□□□□□ -1
ACTB-210ENST00000477812 R4GN34 69 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-210ENST00000477812 Q5VV11 94 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-210ENST00000477812 M0QZ58 72 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-210ENST00000477812 V9GYY9 64 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-210ENST00000477812 SEC61GP60059 68 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-210ENST00000477812 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-210ENST00000477812 Q1T7F1 81 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-210ENST00000477812 PRR15LQ9BU68 103 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GU69 56 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-210ENST00000477812 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-210ENST00000477812 LINC01554Q52M75 96 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GU33 70 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-210ENST00000477812 PSPHP1O15172 72 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-210ENST00000477812 A6NN06 94 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP10-5P60370 271 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-210ENST00000477812 PLAC4Q8WY50 150 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-210ENST00000477812 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-210ENST00000477812 MT1XP80297 61 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-210ENST00000477812 UQCR11O14957 56 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-210ENST00000477812 A0A0D9SG42 100 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTB-210ENST00000477812 A6NED7 52 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-210ENST00000477812 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-210ENST00000477812 A8MU10 97 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-210ENST00000477812 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP12-1P59990 96 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-210ENST00000477812 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP12-2P59991 146 aa8.19□□□□□ -1.1
ACTB-210ENST00000477812 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTB-210ENST00000477812 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.13□□□□□ -1.11
ACTB-210ENST00000477812 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.12□□□□□ -1.11
ACTB-210ENST00000477812 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ACTB-210ENST00000477812 BRK1Q8WUW1 75 aa8.01□□□□□ -1.13
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
ACTB-210ENST00000477812 K7ERS5 55 aa7.98□□□□□ -1.13
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP10-12P60413 245 aa7.96□□□□□ -1.14
ACTB-210ENST00000477812 KMT2DO14686 5537 aa7.9□□□□□ -1.15
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.89□□□□□ -1.15
ACTB-210ENST00000477812 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.85□□□□□ -1.15
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-9P26371 169 aa7.78□□□□□ -1.16
ACTB-210ENST00000477812 PRO0628Q9UI54 55 aa7.76□□□□□ -1.17
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.75□□□□□ -1.17
ACTB-210ENST00000477812 TNP1P09430 55 aa7.66□□□□□ -1.18
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-210ENST00000477812 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-210ENST00000477812 PMAIP1Q13794 54 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-210ENST00000477812 NEBP20929 6669 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-210ENST00000477812 ROMO1P60602 79 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-210ENST00000477812 LCE3AQ5TA76 89 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-210ENST00000477812 MDN1Q9NU22 5596 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-210ENST00000477812 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-210ENST00000477812 MT1EP04732 61 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2EP22531 72 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2BP35325 72 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2AP35326 72 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.27□□□□□ -1.25
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