RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 Q5VSD8 79 aa8.43□□□□□ -1.06
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TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.4□□□□□ -1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 RYR1P21817 5038 aa8.4□□□□□ -1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.39□□□□□ -1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 H0YAA0 97 aa8.39□□□□□ -1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 P0C880 135 aa8.38□□□□□ -1.07
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TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1B0GU33 70 aa8.36□□□□□ -1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.35□□□□□ -1.07
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TSPAN4-211ENST00000468468 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.32□□□□□ -1.08
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TSPAN4-211ENST00000468468 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0D9SG42 100 aa7.97□□□□□ -1.13
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TSPAN4-211ENST00000468468 M0QZ58 72 aa7.64□□□□□ -1.19
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TSPAN4-211ENST00000468468 R4GN34 69 aa7.47□□□□□ -1.21
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TSPAN4-211ENST00000468468 MT1HP80294 61 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN4-211ENST00000468468 TNP1P09430 55 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN4-211ENST00000468468 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.7□□□□□ -1.34
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TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-10P60014 251 aa6.63□□□□□ -1.35
TSPAN4-211ENST00000468468 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.55□□□□□ -1.36
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TSPAN4-211ENST00000468468 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.46□□□□□ -1.38
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.4□□□□□ -1.39
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TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-5P60370 271 aa6.3□□□□□ -1.4
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TSPAN4-211ENST00000468468 MT1XP80297 61 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN4-211ENST00000468468 INE1O15225 51 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-12P60413 245 aa6.18□□□□□ -1.42
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP12-3P60328 96 aa6.15□□□□□ -1.42
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TSPAN4-211ENST00000468468 SSPOA2VEC9 5147 aa5.76□□□□□ -1.49
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TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.62□□□□□ -1.51
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.6□□□□□ -1.51
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.59□□□□□ -1.52
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.53□□□□□ -1.52
TSPAN4-211ENST00000468468 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.5□□□□□ -1.53
TSPAN4-211ENST00000468468 MT1LQ93083 61 aa5.44□□□□□ -1.54
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