RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 SCGB1A1P11684 91 aa5.25□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.25□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 ATOX1O00244 68 aa5.24□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 IMUPQ9GZP8 106 aa5.24□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.23□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.23□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE4AQ5TA78 99 aa5.23□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-10P60014 251 aa5.22□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 C5orf47Q569G3 176 aa5.22□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 MP68P56378 58 aa5.21□□□□□ -1.58
RPRD1B-202ENST00000449186 LCA10Q71F78 164 aa5.21□□□□□ -1.58
RPRD1B-202ENST00000449186 S4R3F8 94 aa5.2□□□□□ -1.58
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.19□□□□□ -1.58
RPRD1B-202ENST00000449186 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.16□□□□□ -1.58
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.15□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.15□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.14□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BPC8 53 aa5.13□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 CSAG1Q6PB30 78 aa5.12□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.12□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 SNURFQ9Y675 71 aa5.1□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.09□□□□□ -1.59
RPRD1B-202ENST00000449186 USH2AO75445 5202 aa5.07□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MUN3 132 aa5.06□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 SERP2Q8N6R1 65 aa5.05□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 DMAC1Q96GE9 116 aa5.05□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 C20orf197Q8N268 126 aa5.04□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFC1O43677 76 aa5.03□□□□□ -1.6
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.02□□□□□ -1.61
RPRD1B-202ENST00000449186 SSPOA2VEC9 5147 aa4.99□□□□□ -1.61
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.98□□□□□ -1.61
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.97□□□□□ -1.61
RPRD1B-202ENST00000449186 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.97□□□□□ -1.61
RPRD1B-202ENST00000449186 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.96□□□□□ -1.62
RPRD1B-202ENST00000449186 COX7CP15954 63 aa4.95□□□□□ -1.62
RPRD1B-202ENST00000449186 ACYP2P14621 99 aa4.93□□□□□ -1.62
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.93□□□□□ -1.62
RPRD1B-202ENST00000449186 H0YAA0 97 aa4.91□□□□□ -1.62
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1BP07438 61 aa4.9□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 P0C880 135 aa4.9□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.9□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.88□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.87□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.87□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC179H3BU77 68 aa4.86□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 H7BZZ5 65 aa4.86□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.85□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RPRD1B-202ENST00000449186 Q5VV11 94 aa4.83□□□□□ -1.64
RPRD1B-202ENST00000449186 CRIPTQ9P021 101 aa4.83□□□□□ -1.64
RPRD1B-202ENST00000449186 COA5Q86WW8 74 aa4.81□□□□□ -1.64
RPRD1B-202ENST00000449186 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.78□□□□□ -1.64
RPRD1B-202ENST00000449186 M0QZ58 72 aa4.76□□□□□ -1.65
RPRD1B-202ENST00000449186 R4GN34 69 aa4.75□□□□□ -1.65
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01554Q52M75 96 aa4.72□□□□□ -1.65
RPRD1B-202ENST00000449186 A6NN06 94 aa4.71□□□□□ -1.66
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-5P60370 271 aa4.7□□□□□ -1.66
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.69□□□□□ -1.66
RPRD1B-202ENST00000449186 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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RPRD1B-202ENST00000449186 PLAC4Q8WY50 150 aa4.63□□□□□ -1.67
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM258P61165 79 aa4.57□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.57□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 SEC61GP60059 68 aa4.56□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.56□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0D9SG42 100 aa4.54□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GU33 70 aa4.53□□□□□ -1.68
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GU69 56 aa4.52□□□□□ -1.69
RPRD1B-202ENST00000449186 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.51□□□□□ -1.69
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.48□□□□□ -1.69
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MU10 97 aa4.46□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.46□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 KMT2DO14686 5537 aa4.43□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 PCP4P48539 62 aa4.43□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP12-1P59990 96 aa4.43□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP12-2P59991 146 aa4.42□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.42□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.41□□□□□ -1.7
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR15LQ9BU68 103 aa4.38□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.37□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-12P60413 245 aa4.37□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.37□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-9P26371 169 aa4.36□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.35□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.34□□□□□ -1.71
RPRD1B-202ENST00000449186 PSPHP1O15172 72 aa4.32□□□□□ -1.72
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.31□□□□□ -1.72
RPRD1B-202ENST00000449186 NEBP20929 6669 aa4.3□□□□□ -1.72
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.29□□□□□ -1.72
RPRD1B-202ENST00000449186 Q1T7F1 81 aa4.28□□□□□ -1.72
RPRD1B-202ENST00000449186 UQCR11O14957 56 aa4.27□□□□□ -1.73
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.25□□□□□ -1.73
RPRD1B-202ENST00000449186 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.25□□□□□ -1.73
RPRD1B-202ENST00000449186 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.23□□□□□ -1.73
RPRD1B-202ENST00000449186 V9GYY9 64 aa4.22□□□□□ -1.73
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2EP22531 72 aa4.2□□□□□ -1.74
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2BP35325 72 aa4.2□□□□□ -1.74
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