RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429368.1

MEG9-201, Transcript of maternally expressed 9, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEG9, Length 2,638 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG9-201ENST00000429368 XP32Q5T750 250 aa8.29□□□□□ -1.08
MEG9-201ENST00000429368 LRP2P98164 4655 aa8.25□□□□□ -1.09
MEG9-201ENST00000429368 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.24□□□□□ -1.09
MEG9-201ENST00000429368 A0A1B0GU69 56 aa8.23□□□□□ -1.09
MEG9-201ENST00000429368 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
MEG9-201ENST00000429368 A6NN06 94 aa8.18□□□□□ -1.1
MEG9-201ENST00000429368 TPRXLQ17RH7 258 aa8.16□□□□□ -1.1
MEG9-201ENST00000429368 HERC1Q15751 4861 aa8.13□□□□□ -1.11
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.11□□□□□ -1.11
MEG9-201ENST00000429368 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.08□□□□□ -1.12
MEG9-201ENST00000429368 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.04□□□□□ -1.12
MEG9-201ENST00000429368 UQCR11O14957 56 aa8.03□□□□□ -1.12
MEG9-201ENST00000429368 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.03□□□□□ -1.12
MEG9-201ENST00000429368 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.98□□□□□ -1.13
MEG9-201ENST00000429368 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.97□□□□□ -1.13
MEG9-201ENST00000429368 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.96□□□□□ -1.14
MEG9-201ENST00000429368 PRAC1Q96KF2 57 aa7.94□□□□□ -1.14
MEG9-201ENST00000429368 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.93□□□□□ -1.14
MEG9-201ENST00000429368 H0YAA0 97 aa7.88□□□□□ -1.15
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.88□□□□□ -1.15
MEG9-201ENST00000429368 MUC17Q685J3 4493 aa7.87□□□□□ -1.15
MEG9-201ENST00000429368 MUC2Q02817 5179 aa7.85□□□□□ -1.15
MEG9-201ENST00000429368 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
MEG9-201ENST00000429368 A0A1B0GU33 70 aa7.81□□□□□ -1.16
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.81□□□□□ -1.16
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.81□□□□□ -1.16
MEG9-201ENST00000429368 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.77□□□□□ -1.17
MEG9-201ENST00000429368 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.69□□□□□ -1.18
MEG9-201ENST00000429368 S4R3F8 94 aa7.68□□□□□ -1.18
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
MEG9-201ENST00000429368 CSAG1Q6PB30 78 aa7.65□□□□□ -1.18
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.64□□□□□ -1.19
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.63□□□□□ -1.19
MEG9-201ENST00000429368 RNF213Q63HN8 5207 aa7.6□□□□□ -1.19
MEG9-201ENST00000429368 A0A0D9SG42 100 aa7.58□□□□□ -1.2
MEG9-201ENST00000429368 P0C880 135 aa7.58□□□□□ -1.2
MEG9-201ENST00000429368 CRIPTQ9P021 101 aa7.53□□□□□ -1.2
MEG9-201ENST00000429368 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.51□□□□□ -1.21
MEG9-201ENST00000429368 LINC01554Q52M75 96 aa7.48□□□□□ -1.21
MEG9-201ENST00000429368 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MEG9-201ENST00000429368 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MEG9-201ENST00000429368 K7ERS5 55 aa7.43□□□□□ -1.22
MEG9-201ENST00000429368 LCE2CQ5TA81 110 aa7.42□□□□□ -1.22
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.38□□□□□ -1.23
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP12-2P59991 146 aa7.35□□□□□ -1.23
MEG9-201ENST00000429368 ROMO1P60602 79 aa7.31□□□□□ -1.24
MEG9-201ENST00000429368 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.29□□□□□ -1.24
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP12-1P59990 96 aa7.26□□□□□ -1.25
MEG9-201ENST00000429368 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.24□□□□□ -1.25
MEG9-201ENST00000429368 MT1HP80294 61 aa7.24□□□□□ -1.25
MEG9-201ENST00000429368 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.23□□□□□ -1.25
MEG9-201ENST00000429368 M0QZ58 72 aa7.15□□□□□ -1.26
MEG9-201ENST00000429368 M0R2T5 61 aa7.15□□□□□ -1.26
MEG9-201ENST00000429368 R4GN34 69 aa7.1□□□□□ -1.27
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7□□□□□ -1.29
MEG9-201ENST00000429368 MT2AP02795 61 aa6.97□□□□□ -1.29
MEG9-201ENST00000429368 MT1FP04733 61 aa6.97□□□□□ -1.29
MEG9-201ENST00000429368 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP10-10P60014 251 aa6.91□□□□□ -1.3
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.87□□□□□ -1.31
MEG9-201ENST00000429368 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.83□□□□□ -1.32
MEG9-201ENST00000429368 LCE2BO14633 110 aa6.74□□□□□ -1.33
MEG9-201ENST00000429368 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.74□□□□□ -1.33
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.73□□□□□ -1.33
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.72□□□□□ -1.33
MEG9-201ENST00000429368 LUZP6Q538Z0 58 aa6.69□□□□□ -1.34
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.63□□□□□ -1.35
MEG9-201ENST00000429368 MT1BP07438 61 aa6.61□□□□□ -1.35
MEG9-201ENST00000429368 PLAC4Q8WY50 150 aa6.59□□□□□ -1.35
MEG9-201ENST00000429368 NDUFAF8A1L188 74 aa6.58□□□□□ -1.36
MEG9-201ENST00000429368 USH2AO75445 5202 aa6.54□□□□□ -1.36
MEG9-201ENST00000429368 TNP1P09430 55 aa6.41□□□□□ -1.38
MEG9-201ENST00000429368 MT1XP80297 61 aa6.41□□□□□ -1.38
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP10-5P60370 271 aa6.41□□□□□ -1.38
MEG9-201ENST00000429368 PP632Q6XCG6 107 aa6.4□□□□□ -1.39
MEG9-201ENST00000429368 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.31□□□□□ -1.4
MEG9-201ENST00000429368 SSPOA2VEC9 5147 aa6.26□□□□□ -1.41
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
MEG9-201ENST00000429368 LCE3AQ5TA76 89 aa6.19□□□□□ -1.42
MEG9-201ENST00000429368 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.19□□□□□ -1.42
MEG9-201ENST00000429368 KMT2DO14686 5537 aa6.12□□□□□ -1.43
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP10-12P60413 245 aa6.07□□□□□ -1.44
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.04□□□□□ -1.44
MEG9-201ENST00000429368 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6□□□□□ -1.45
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.98□□□□□ -1.45
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.98□□□□□ -1.45
MEG9-201ENST00000429368 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.93□□□□□ -1.46
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.91□□□□□ -1.46
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP12-3P60328 96 aa5.85□□□□□ -1.47
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.83□□□□□ -1.48
MEG9-201ENST00000429368 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.73□□□□□ -1.49
MEG9-201ENST00000429368 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.7□□□□□ -1.5
MEG9-201ENST00000429368 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
MEG9-201ENST00000429368 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MEG9-201ENST00000429368 MT1EP04732 61 aa5.59□□□□□ -1.51
MEG9-201ENST00000429368 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.59□□□□□ -1.52
MEG9-201ENST00000429368 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.49□□□□□ -1.53
MEG9-201ENST00000429368 MT1LQ93083 61 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms