RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 LCA10Q71F78 164 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA4-202ENST00000428284 ACYP2P14621 99 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HOXA4-202ENST00000428284 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXA4-202ENST00000428284 CSAG1Q6PB30 78 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXA4-202ENST00000428284 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXA4-202ENST00000428284 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM258P61165 79 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXA4-202ENST00000428284 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HOXA4-202ENST00000428284 COA5Q86WW8 74 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXA4-202ENST00000428284 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HOXA4-202ENST00000428284 MT2AP02795 61 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXA4-202ENST00000428284 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXA4-202ENST00000428284 MT1FP04733 61 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-10P60014 251 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXA4-202ENST00000428284 H0YAA0 97 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXA4-202ENST00000428284 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXA4-202ENST00000428284 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXA4-202ENST00000428284 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXA4-202ENST00000428284 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXA4-202ENST00000428284 P0C880 135 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXA4-202ENST00000428284 CRIPTQ9P021 101 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXA4-202ENST00000428284 SEC61GP60059 68 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA4-202ENST00000428284 USH2AO75445 5202 aa9.27□□□□□ -0.92
HOXA4-202ENST00000428284 LCE2BO14633 110 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 R4GN34 69 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PRO0628Q9UI54 55 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GU69 56 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 M0QZ58 72 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXA4-202ENST00000428284 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SSPOA2VEC9 5147 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXA4-202ENST00000428284 PRR15LQ9BU68 103 aa9.14□□□□□ -0.95
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GU33 70 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 Q1T7F1 81 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 LINC01554Q52M75 96 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 Q5VV11 94 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 V9GYY9 64 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXA4-202ENST00000428284 MT1BP07438 61 aa9□□□□□ -0.97
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXA4-202ENST00000428284 PSPHP1O15172 72 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXA4-202ENST00000428284 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PLAC4Q8WY50 150 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0D9SG42 100 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXA4-202ENST00000428284 BRK1Q8WUW1 75 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXA4-202ENST00000428284 UQCR11O14957 56 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXA4-202ENST00000428284 A6NN06 94 aa8.83□□□□□ -1
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HOXA4-202ENST00000428284 A8MU10 97 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXA4-202ENST00000428284 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 PMAIP1Q13794 54 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 A6NED7 52 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP12-1P59990 96 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-5P60370 271 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP12-2P59991 146 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXA4-202ENST00000428284 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXA4-202ENST00000428284 MT1XP80297 61 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXA4-202ENST00000428284 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXA4-202ENST00000428284 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXA4-202ENST00000428284 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXA4-202ENST00000428284 K7ERS5 55 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXA4-202ENST00000428284 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HOXA4-202ENST00000428284 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-12P60413 245 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXA4-202ENST00000428284 TNP1P09430 55 aa8.1□□□□□ -1.11
HOXA4-202ENST00000428284 KMT2DO14686 5537 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.99□□□□□ -1.13
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP5-9P26371 169 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXA4-202ENST00000428284 ROMO1P60602 79 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXA4-202ENST00000428284 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXA4-202ENST00000428284 NEBP20929 6669 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXA4-202ENST00000428284 LCE3AQ5TA76 89 aa7.83□□□□□ -1.16
HOXA4-202ENST00000428284 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.82□□□□□ -1.16
HOXA4-202ENST00000428284 MDN1Q9NU22 5596 aa7.81□□□□□ -1.16
HOXA4-202ENST00000428284 PRAC1Q96KF2 57 aa7.71□□□□□ -1.17
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXA4-202ENST00000428284 SPRR2EP22531 72 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXA4-202ENST00000428284 SPRR2BP35325 72 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXA4-202ENST00000428284 SPRR2AP35326 72 aa7.64□□□□□ -1.19
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