RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-8P60410 259 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-202ENST00000420808 H0YAA0 97 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-202ENST00000420808 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-202ENST00000420808 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-202ENST00000420808 LRP2P98164 4655 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-202ENST00000420808 XP32Q5T750 250 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GU33 70 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-202ENST00000420808 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NISCH-202ENST00000420808 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-202ENST00000420808 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-202ENST00000420808 MT1HL1P0DM35 61 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-202ENST00000420808 CSAG1Q6PB30 78 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-202ENST00000420808 S4R3F8 94 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-202ENST00000420808 P0C880 135 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-202ENST00000420808 A0A0D9SG42 100 aa7.8□□□□□ -1.16
NISCH-202ENST00000420808 CRIPTQ9P021 101 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-202ENST00000420808 LINC01554Q52M75 96 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-202ENST00000420808 TPRXLQ17RH7 258 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-202ENST00000420808 MUC17Q685J3 4493 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-202ENST00000420808 K7ERS5 55 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-202ENST00000420808 HERC2O95714 4834 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP12-2P59991 146 aa7.59□□□□□ -1.19
NISCH-202ENST00000420808 MUC2Q02817 5179 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-202ENST00000420808 ROMO1P60602 79 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-202ENST00000420808 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP12-1P59990 96 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-202ENST00000420808 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-202ENST00000420808 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
NISCH-202ENST00000420808 J3QL48 77 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-202ENST00000420808 HERC1Q15751 4861 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-202ENST00000420808 M0QZ58 72 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-202ENST00000420808 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NISCH-202ENST00000420808 H3BS24 57 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-202ENST00000420808 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-202ENST00000420808 R4GN34 69 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-202ENST00000420808 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-202ENST00000420808 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-202ENST00000420808 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NISCH-202ENST00000420808 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-202ENST00000420808 RNF213Q63HN8 5207 aa7.02□□□□□ -1.29
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.98□□□□□ -1.29
NISCH-202ENST00000420808 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.96□□□□□ -1.3
NISCH-202ENST00000420808 LCE2CQ5TA81 110 aa6.91□□□□□ -1.3
NISCH-202ENST00000420808 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.9□□□□□ -1.3
NISCH-202ENST00000420808 NDUFAF8A1L188 74 aa6.82□□□□□ -1.32
NISCH-202ENST00000420808 MT1HP80294 61 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-202ENST00000420808 M0R2T5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.69□□□□□ -1.34
NISCH-202ENST00000420808 PLAC4Q8WY50 150 aa6.69□□□□□ -1.34
NISCH-202ENST00000420808 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-202ENST00000420808 MT1FP04733 61 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-202ENST00000420808 TNP1P09430 55 aa6.59□□□□□ -1.35
NISCH-202ENST00000420808 MT2AP02795 61 aa6.59□□□□□ -1.36
NISCH-202ENST00000420808 PP632Q6XCG6 107 aa6.58□□□□□ -1.36
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-10P60014 251 aa6.56□□□□□ -1.36
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.55□□□□□ -1.36
NISCH-202ENST00000420808 A0A0A0MQY5 61 aa6.43□□□□□ -1.38
NISCH-202ENST00000420808 LCE3AQ5TA76 89 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-202ENST00000420808 MT1BP07438 61 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.34□□□□□ -1.39
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.33□□□□□ -1.4
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-5P60370 271 aa6.3□□□□□ -1.4
NISCH-202ENST00000420808 MT1XP80297 61 aa6.3□□□□□ -1.4
NISCH-202ENST00000420808 USH2AO75445 5202 aa6.27□□□□□ -1.41
NISCH-202ENST00000420808 LUZP6Q538Z0 58 aa6.26□□□□□ -1.41
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.26□□□□□ -1.41
NISCH-202ENST00000420808 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
NISCH-202ENST00000420808 KMT2DO14686 5537 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-12P60413 245 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-202ENST00000420808 LCE2BO14633 110 aa6.09□□□□□ -1.44
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP12-3P60328 96 aa6.02□□□□□ -1.45
NISCH-202ENST00000420808 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
NISCH-202ENST00000420808 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-202ENST00000420808 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.76□□□□□ -1.49
NISCH-202ENST00000420808 SSPOA2VEC9 5147 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-202ENST00000420808 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.65□□□□□ -1.5
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-202ENST00000420808 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
NISCH-202ENST00000420808 MT1EP04732 61 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-202ENST00000420808 MT1LQ93083 61 aa5.42□□□□□ -1.54
NISCH-202ENST00000420808 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.4□□□□□ -1.54
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.35□□□□□ -1.55
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-202ENST00000420808 INE1O15225 51 aa5.28□□□□□ -1.56
NISCH-202ENST00000420808 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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