RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407654.7

ERLIN1-202, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERLIN1, Length 1,453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-202ENST00000407654 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.16□□□□□ -1.26
ERLIN1-202ENST00000407654 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
ERLIN1-202ENST00000407654 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.08□□□□□ -1.28
ERLIN1-202ENST00000407654 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.07□□□□□ -1.28
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.05□□□□□ -1.28
ERLIN1-202ENST00000407654 MUC2Q02817 5179 aa7.03□□□□□ -1.28
ERLIN1-202ENST00000407654 SMIM26A0A096LP01 95 aa7□□□□□ -1.29
ERLIN1-202ENST00000407654 S4R3F8 94 aa7□□□□□ -1.29
ERLIN1-202ENST00000407654 LCA10Q71F78 164 aa6.98□□□□□ -1.29
ERLIN1-202ENST00000407654 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.96□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.94□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.94□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.93□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 LCE2CQ5TA81 110 aa6.92□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ERLIN1-202ENST00000407654 Q1T7F1 81 aa6.87□□□□□ -1.31
ERLIN1-202ENST00000407654 CSAG1Q6PB30 78 aa6.85□□□□□ -1.31
ERLIN1-202ENST00000407654 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.85□□□□□ -1.31
ERLIN1-202ENST00000407654 V9GYY9 64 aa6.85□□□□□ -1.31
ERLIN1-202ENST00000407654 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ERLIN1-202ENST00000407654 MT1HP80294 61 aa6.77□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 PRR15LQ9BU68 103 aa6.77□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 A0A1B0GU69 56 aa6.76□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.74□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 PSPHP1O15172 72 aa6.74□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 SEC61GP60059 68 aa6.74□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.73□□□□□ -1.33
ERLIN1-202ENST00000407654 H0YAA0 97 aa6.7□□□□□ -1.34
ERLIN1-202ENST00000407654 Q5VV11 94 aa6.7□□□□□ -1.34
ERLIN1-202ENST00000407654 M0R2T5 61 aa6.68□□□□□ -1.34
ERLIN1-202ENST00000407654 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.68□□□□□ -1.34
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ERLIN1-202ENST00000407654 P0C880 135 aa6.63□□□□□ -1.35
ERLIN1-202ENST00000407654 A0A1B0GU33 70 aa6.59□□□□□ -1.36
ERLIN1-202ENST00000407654 A6NED7 52 aa6.54□□□□□ -1.36
ERLIN1-202ENST00000407654 UQCR11O14957 56 aa6.53□□□□□ -1.36
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.51□□□□□ -1.37
ERLIN1-202ENST00000407654 MT2AP02795 61 aa6.49□□□□□ -1.37
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.47□□□□□ -1.37
ERLIN1-202ENST00000407654 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.47□□□□□ -1.37
ERLIN1-202ENST00000407654 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.47□□□□□ -1.37
ERLIN1-202ENST00000407654 M0QZ58 72 aa6.46□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.45□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 MT1FP04733 61 aa6.45□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 CRIPTQ9P021 101 aa6.44□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP10-10P60014 251 aa6.43□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 R4GN34 69 aa6.43□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.42□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 BRK1Q8WUW1 75 aa6.41□□□□□ -1.38
ERLIN1-202ENST00000407654 A8MU10 97 aa6.37□□□□□ -1.39
ERLIN1-202ENST00000407654 A0A0D9SG42 100 aa6.34□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.33□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 LINC01554Q52M75 96 aa6.31□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.31□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.31□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.28□□□□□ -1.4
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP12-1P59990 96 aa6.23□□□□□ -1.41
ERLIN1-202ENST00000407654 PRO0628Q9UI54 55 aa6.23□□□□□ -1.41
ERLIN1-202ENST00000407654 A6NN06 94 aa6.22□□□□□ -1.41
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP12-2P59991 146 aa6.2□□□□□ -1.42
ERLIN1-202ENST00000407654 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.2□□□□□ -1.42
ERLIN1-202ENST00000407654 K7ERS5 55 aa6.18□□□□□ -1.42
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.18□□□□□ -1.42
ERLIN1-202ENST00000407654 MT1BP07438 61 aa6.1□□□□□ -1.43
ERLIN1-202ENST00000407654 PLAC4Q8WY50 150 aa6.09□□□□□ -1.44
ERLIN1-202ENST00000407654 PMAIP1Q13794 54 aa6.05□□□□□ -1.44
ERLIN1-202ENST00000407654 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.02□□□□□ -1.44
ERLIN1-202ENST00000407654 LCE3BQ5TA77 95 aa6.02□□□□□ -1.45
ERLIN1-202ENST00000407654 USH2AO75445 5202 aa5.99□□□□□ -1.45
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.96□□□□□ -1.45
ERLIN1-202ENST00000407654 ROMO1P60602 79 aa5.93□□□□□ -1.46
ERLIN1-202ENST00000407654 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ERLIN1-202ENST00000407654 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.9□□□□□ -1.46
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.89□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.89□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 MT1XP80297 61 aa5.88□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 SSPOA2VEC9 5147 aa5.88□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP10-5P60370 271 aa5.86□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ERLIN1-202ENST00000407654 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.83□□□□□ -1.48
ERLIN1-202ENST00000407654 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.81□□□□□ -1.48
ERLIN1-202ENST00000407654 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.78□□□□□ -1.48
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.77□□□□□ -1.49
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.74□□□□□ -1.49
ERLIN1-202ENST00000407654 TNP1P09430 55 aa5.73□□□□□ -1.49
ERLIN1-202ENST00000407654 PRAC1Q96KF2 57 aa5.69□□□□□ -1.5
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.64□□□□□ -1.51
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.63□□□□□ -1.51
ERLIN1-202ENST00000407654 NEBP20929 6669 aa5.62□□□□□ -1.51
ERLIN1-202ENST00000407654 LCE1DQ5T752 114 aa5.62□□□□□ -1.51
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP10-12P60413 245 aa5.58□□□□□ -1.52
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.58□□□□□ -1.52
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.54□□□□□ -1.52
ERLIN1-202ENST00000407654 SVIPQ8NHG7 77 aa5.54□□□□□ -1.52
ERLIN1-202ENST00000407654 PP632Q6XCG6 107 aa5.51□□□□□ -1.53
ERLIN1-202ENST00000407654 LCE3AQ5TA76 89 aa5.51□□□□□ -1.53
ERLIN1-202ENST00000407654 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms