RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 MT1HL1P0DM35 61 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-203ENST00000402697 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GU33 70 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-203ENST00000402697 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.8□□□□□ -1.32
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-203ENST00000402697 XP32Q5T750 250 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-203ENST00000402697 H0YAA0 97 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-203ENST00000402697 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.71□□□□□ -1.33
PRAME-203ENST00000402697 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAME-203ENST00000402697 K7ERS5 55 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAME-203ENST00000402697 HERC2O95714 4834 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-203ENST00000402697 S4R3F8 94 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.65□□□□□ -1.35
PRAME-203ENST00000402697 TPRXLQ17RH7 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-203ENST00000402697 PRAC1Q96KF2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-203ENST00000402697 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRAME-203ENST00000402697 LINC01554Q52M75 96 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAME-203ENST00000402697 CSAG1Q6PB30 78 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-203ENST00000402697 LRP2P98164 4655 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-203ENST00000402697 LPAP08519 4548 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-203ENST00000402697 J3QL48 77 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAME-203ENST00000402697 ROMO1P60602 79 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 M0QZ58 72 aa6.41□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 P0C880 135 aa6.41□□□□□ -1.38
PRAME-203ENST00000402697 A0A0D9SG42 100 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-203ENST00000402697 HERC1Q15751 4861 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-203ENST00000402697 H3BS24 57 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-203ENST00000402697 MUC17Q685J3 4493 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP12-1P59990 96 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-203ENST00000402697 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP12-2P59991 146 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-203ENST00000402697 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-203ENST00000402697 CRIPTQ9P021 101 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-203ENST00000402697 R4GN34 69 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-203ENST00000402697 MUC2Q02817 5179 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-203ENST00000402697 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-203ENST00000402697 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-203ENST00000402697 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PRAME-203ENST00000402697 RNF213Q63HN8 5207 aa5.95□□□□□ -1.46
PRAME-203ENST00000402697 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRAME-203ENST00000402697 A0A0A0MQY5 61 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-203ENST00000402697 LCE2CQ5TA81 110 aa5.89□□□□□ -1.47
PRAME-203ENST00000402697 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-203ENST00000402697 PP632Q6XCG6 107 aa5.86□□□□□ -1.47
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-203ENST00000402697 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-203ENST00000402697 MT1HP80294 61 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-203ENST00000402697 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.68□□□□□ -1.5
PRAME-203ENST00000402697 TNP1P09430 55 aa5.68□□□□□ -1.5
PRAME-203ENST00000402697 PLAC4Q8WY50 150 aa5.67□□□□□ -1.5
PRAME-203ENST00000402697 M0R2T5 61 aa5.65□□□□□ -1.51
PRAME-203ENST00000402697 NDUFAF8A1L188 74 aa5.59□□□□□ -1.51
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.57□□□□□ -1.52
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-203ENST00000402697 MT2AP02795 61 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-203ENST00000402697 MT1FP04733 61 aa5.54□□□□□ -1.52
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-10P60014 251 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.46□□□□□ -1.54
PRAME-203ENST00000402697 LUZP6Q538Z0 58 aa5.45□□□□□ -1.54
PRAME-203ENST00000402697 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PRAME-203ENST00000402697 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PRAME-203ENST00000402697 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-203ENST00000402697 MT1BP07438 61 aa5.29□□□□□ -1.56
PRAME-203ENST00000402697 LCE3AQ5TA76 89 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-5P60370 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-203ENST00000402697 MT1XP80297 61 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-203ENST00000402697 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-203ENST00000402697 LCE2BO14633 110 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-12P60413 245 aa5.15□□□□□ -1.59
PRAME-203ENST00000402697 USH2AO75445 5202 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP12-3P60328 96 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PRAME-203ENST00000402697 SSPOA2VEC9 5147 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.83□□□□□ -1.64
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.81□□□□□ -1.64
PRAME-203ENST00000402697 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.8□□□□□ -1.64
PRAME-203ENST00000402697 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-203ENST00000402697 KMT2DO14686 5537 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-203ENST00000402697 INE1O15225 51 aa4.73□□□□□ -1.65
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.66□□□□□ -1.66
PRAME-203ENST00000402697 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-203ENST00000402697 MT1EP04732 61 aa4.56□□□□□ -1.68
PRAME-203ENST00000402697 MT1LQ93083 61 aa4.55□□□□□ -1.68
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.48□□□□□ -1.69
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.44□□□□□ -1.7
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