RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 H7BZZ5 65 aa11.27□□□□□ -0.6
PDSS1-201ENST00000376215 NDUFC1O43677 76 aa11.27□□□□□ -0.61
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa11.24□□□□□ -0.61
PDSS1-201ENST00000376215 ACYP2P14621 99 aa11.2□□□□□ -0.62
PDSS1-201ENST00000376215 CSAG1Q6PB30 78 aa11.2□□□□□ -0.62
PDSS1-201ENST00000376215 MT2AP02795 61 aa11.14□□□□□ -0.63
PDSS1-201ENST00000376215 MT1FP04733 61 aa11.07□□□□□ -0.64
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-10P60014 251 aa10.99□□□□□ -0.65
PDSS1-201ENST00000376215 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.98□□□□□ -0.65
PDSS1-201ENST00000376215 COA5Q86WW8 74 aa10.97□□□□□ -0.65
PDSS1-201ENST00000376215 PCP4P48539 62 aa10.9□□□□□ -0.66
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM258P61165 79 aa10.89□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 H0YAA0 97 aa10.88□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.88□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa10.86□□□□□ -0.67
PDSS1-201ENST00000376215 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.81□□□□□ -0.68
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.79□□□□□ -0.68
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.74□□□□□ -0.69
PDSS1-201ENST00000376215 P0C880 135 aa10.7□□□□□ -0.7
PDSS1-201ENST00000376215 LCE2BO14633 110 aa10.66□□□□□ -0.7
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.65□□□□□ -0.7
PDSS1-201ENST00000376215 CRIPTQ9P021 101 aa10.61□□□□□ -0.71
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.59□□□□□ -0.71
PDSS1-201ENST00000376215 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.55□□□□□ -0.72
PDSS1-201ENST00000376215 USH2AO75445 5202 aa10.54□□□□□ -0.72
PDSS1-201ENST00000376215 FSIP2Q5CZC0 6907 aa10.53□□□□□ -0.72
PDSS1-201ENST00000376215 R4GN34 69 aa10.46□□□□□ -0.74
PDSS1-201ENST00000376215 SEC61GP60059 68 aa10.44□□□□□ -0.74
PDSS1-201ENST00000376215 M0QZ58 72 aa10.43□□□□□ -0.74
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10.41□□□□□ -0.74
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GU69 56 aa10.36□□□□□ -0.75
PDSS1-201ENST00000376215 MT1BP07438 61 aa10.35□□□□□ -0.75
PDSS1-201ENST00000376215 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.34□□□□□ -0.75
PDSS1-201ENST00000376215 SSPOA2VEC9 5147 aa10.33□□□□□ -0.76
PDSS1-201ENST00000376215 Q5VV11 94 aa10.32□□□□□ -0.76
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.3□□□□□ -0.76
PDSS1-201ENST00000376215 CRCT1Q9UGL9 99 aa10.29□□□□□ -0.76
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GU33 70 aa10.25□□□□□ -0.77
PDSS1-201ENST00000376215 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PDSS1-201ENST00000376215 LINC01554Q52M75 96 aa10.24□□□□□ -0.77
PDSS1-201ENST00000376215 PRR15LQ9BU68 103 aa10.22□□□□□ -0.77
PDSS1-201ENST00000376215 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.18□□□□□ -0.78
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.17□□□□□ -0.78
PDSS1-201ENST00000376215 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.15□□□□□ -0.78
PDSS1-201ENST00000376215 Q1T7F1 81 aa10.15□□□□□ -0.79
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa10.14□□□□□ -0.79
PDSS1-201ENST00000376215 V9GYY9 64 aa10.11□□□□□ -0.79
PDSS1-201ENST00000376215 PLAC4Q8WY50 150 aa10.05□□□□□ -0.8
PDSS1-201ENST00000376215 A6NN06 94 aa10.03□□□□□ -0.8
PDSS1-201ENST00000376215 PSPHP1O15172 72 aa10.03□□□□□ -0.8
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0D9SG42 100 aa10.01□□□□□ -0.81
PDSS1-201ENST00000376215 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PDSS1-201ENST00000376215 A8MU10 97 aa9.93□□□□□ -0.82
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-5P60370 271 aa9.93□□□□□ -0.82
PDSS1-201ENST00000376215 UQCR11O14957 56 aa9.93□□□□□ -0.82
PDSS1-201ENST00000376215 MT1XP80297 61 aa9.87□□□□□ -0.83
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP12-1P59990 96 aa9.85□□□□□ -0.83
PDSS1-201ENST00000376215 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.81□□□□□ -0.84
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP12-2P59991 146 aa9.8□□□□□ -0.84
PDSS1-201ENST00000376215 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.78□□□□□ -0.84
PDSS1-201ENST00000376215 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.77□□□□□ -0.85
PDSS1-201ENST00000376215 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.71□□□□□ -0.85
PDSS1-201ENST00000376215 A6NED7 52 aa9.69□□□□□ -0.86
PDSS1-201ENST00000376215 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDSS1-201ENST00000376215 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.43□□□□□ -0.9
PDSS1-201ENST00000376215 K7ERS5 55 aa9.39□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-12P60413 245 aa9.36□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.36□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 KMT2DO14686 5537 aa9.32□□□□□ -0.92
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.24□□□□□ -0.93
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.24□□□□□ -0.93
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.23□□□□□ -0.93
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.15□□□□□ -0.94
PDSS1-201ENST00000376215 TNP1P09430 55 aa9.13□□□□□ -0.95
PDSS1-201ENST00000376215 BRK1Q8WUW1 75 aa9.13□□□□□ -0.95
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.12□□□□□ -0.95
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP5-9P26371 169 aa9.05□□□□□ -0.96
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.96□□□□□ -0.98
PDSS1-201ENST00000376215 ROMO1P60602 79 aa8.95□□□□□ -0.98
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.94□□□□□ -0.98
PDSS1-201ENST00000376215 LCE3AQ5TA76 89 aa8.92□□□□□ -0.98
PDSS1-201ENST00000376215 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.86□□□□□ -0.99
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.82□□□□□ -1
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.76□□□□□ -1.01
PDSS1-201ENST00000376215 MDN1Q9NU22 5596 aa8.72□□□□□ -1.01
PDSS1-201ENST00000376215 MT1EP04732 61 aa8.69□□□□□ -1.02
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.65□□□□□ -1.02
PDSS1-201ENST00000376215 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.65□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2EP22531 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2BP35325 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2AP35326 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 NEBP20929 6669 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 PMAIP1Q13794 54 aa8.61□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 PRO0628Q9UI54 55 aa8.6□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP12-3P60328 96 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.9 ms