RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.33□□□□□ -0.92
MAPRE1-201ENST00000375571 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.3□□□□□ -0.92
MAPRE1-201ENST00000375571 UQCR11O14957 56 aa9.29□□□□□ -0.92
MAPRE1-201ENST00000375571 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.27□□□□□ -0.93
MAPRE1-201ENST00000375571 XP32Q5T750 250 aa9.18□□□□□ -0.94
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.15□□□□□ -0.94
MAPRE1-201ENST00000375571 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.15□□□□□ -0.94
MAPRE1-201ENST00000375571 PRAC1Q96KF2 57 aa9.14□□□□□ -0.95
MAPRE1-201ENST00000375571 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.11□□□□□ -0.95
MAPRE1-201ENST00000375571 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.11□□□□□ -0.95
MAPRE1-201ENST00000375571 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
MAPRE1-201ENST00000375571 HERC1Q15751 4861 aa9.07□□□□□ -0.96
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC2Q02817 5179 aa9.05□□□□□ -0.96
MAPRE1-201ENST00000375571 J3QL48 77 aa8.95□□□□□ -0.98
MAPRE1-201ENST00000375571 H0YAA0 97 aa8.94□□□□□ -0.98
MAPRE1-201ENST00000375571 A0A1B0GU33 70 aa8.92□□□□□ -0.98
MAPRE1-201ENST00000375571 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.91□□□□□ -0.98
MAPRE1-201ENST00000375571 TPRXLQ17RH7 258 aa8.9□□□□□ -0.98
MAPRE1-201ENST00000375571 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.87□□□□□ -0.99
MAPRE1-201ENST00000375571 CSAG1Q6PB30 78 aa8.86□□□□□ -0.99
MAPRE1-201ENST00000375571 LINC01554Q52M75 96 aa8.85□□□□□ -0.99
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.77□□□□□ -1.01
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC17Q685J3 4493 aa8.76□□□□□ -1.01
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.73□□□□□ -1.01
MAPRE1-201ENST00000375571 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.7□□□□□ -1.02
MAPRE1-201ENST00000375571 K7ERS5 55 aa8.67□□□□□ -1.02
MAPRE1-201ENST00000375571 RNF213Q63HN8 5207 aa8.66□□□□□ -1.02
MAPRE1-201ENST00000375571 S4R3F8 94 aa8.65□□□□□ -1.03
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.61□□□□□ -1.03
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
MAPRE1-201ENST00000375571 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.59□□□□□ -1.03
MAPRE1-201ENST00000375571 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.58□□□□□ -1.04
MAPRE1-201ENST00000375571 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.52□□□□□ -1.04
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.52□□□□□ -1.05
MAPRE1-201ENST00000375571 P0C880 135 aa8.51□□□□□ -1.05
MAPRE1-201ENST00000375571 A0A0D9SG42 100 aa8.5□□□□□ -1.05
MAPRE1-201ENST00000375571 CRIPTQ9P021 101 aa8.5□□□□□ -1.05
MAPRE1-201ENST00000375571 ROMO1P60602 79 aa8.47□□□□□ -1.05
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.39□□□□□ -1.07
MAPRE1-201ENST00000375571 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP12-2P59991 146 aa8.25□□□□□ -1.09
MAPRE1-201ENST00000375571 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
MAPRE1-201ENST00000375571 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.22□□□□□ -1.09
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP12-1P59990 96 aa8.19□□□□□ -1.1
MAPRE1-201ENST00000375571 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.17□□□□□ -1.1
MAPRE1-201ENST00000375571 M0QZ58 72 aa8.16□□□□□ -1.1
MAPRE1-201ENST00000375571 H3BS24 57 aa8.13□□□□□ -1.11
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE2CQ5TA81 110 aa8.11□□□□□ -1.11
MAPRE1-201ENST00000375571 R4GN34 69 aa8.05□□□□□ -1.12
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
MAPRE1-201ENST00000375571 M0R2T5 61 aa7.93□□□□□ -1.14
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1HP80294 61 aa7.9□□□□□ -1.15
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.84□□□□□ -1.15
MAPRE1-201ENST00000375571 NDUFAF8A1L188 74 aa7.7□□□□□ -1.18
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1FP04733 61 aa7.68□□□□□ -1.18
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.66□□□□□ -1.18
MAPRE1-201ENST00000375571 MT2AP02795 61 aa7.65□□□□□ -1.18
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP10-10P60014 251 aa7.65□□□□□ -1.18
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.63□□□□□ -1.19
MAPRE1-201ENST00000375571 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.6□□□□□ -1.19
MAPRE1-201ENST00000375571 USH2AO75445 5202 aa7.56□□□□□ -1.2
MAPRE1-201ENST00000375571 PLAC4Q8WY50 150 aa7.52□□□□□ -1.21
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.52□□□□□ -1.21
MAPRE1-201ENST00000375571 PP632Q6XCG6 107 aa7.47□□□□□ -1.21
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.34□□□□□ -1.23
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MAPRE1-201ENST00000375571 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.31□□□□□ -1.24
MAPRE1-201ENST00000375571 TNP1P09430 55 aa7.3□□□□□ -1.24
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1BP07438 61 aa7.28□□□□□ -1.24
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.23□□□□□ -1.25
MAPRE1-201ENST00000375571 LUZP6Q538Z0 58 aa7.21□□□□□ -1.26
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE2BO14633 110 aa7.2□□□□□ -1.26
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.18□□□□□ -1.26
MAPRE1-201ENST00000375571 KMT2DO14686 5537 aa7.16□□□□□ -1.26
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP10-5P60370 271 aa7.13□□□□□ -1.27
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1XP80297 61 aa7.13□□□□□ -1.27
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE3AQ5TA76 89 aa6.98□□□□□ -1.29
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
MAPRE1-201ENST00000375571 SSPOA2VEC9 5147 aa6.96□□□□□ -1.29
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.95□□□□□ -1.3
MAPRE1-201ENST00000375571 A0A0A0MQY5 61 aa6.86□□□□□ -1.31
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP10-12P60413 245 aa6.79□□□□□ -1.32
MAPRE1-201ENST00000375571 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.78□□□□□ -1.32
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.75□□□□□ -1.33
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.75□□□□□ -1.33
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.71□□□□□ -1.34
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP12-3P60328 96 aa6.61□□□□□ -1.35
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.56□□□□□ -1.36
MAPRE1-201ENST00000375571 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.45□□□□□ -1.38
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.43□□□□□ -1.38
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.37□□□□□ -1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.29□□□□□ -1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.22□□□□□ -1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.22□□□□□ -1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 INE1O15225 51 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 544.6 ms