RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 KLKP1Q107X0 134 aa6.85□□□□□ -1.31
CSAG1-202ENST00000370287 H3BS24 57 aa6.84□□□□□ -1.31
CSAG1-202ENST00000370287 MP68P56378 58 aa6.81□□□□□ -1.32
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.8□□□□□ -1.32
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.78□□□□□ -1.32
CSAG1-202ENST00000370287 MT-ATP8P03928 68 aa6.77□□□□□ -1.33
CSAG1-202ENST00000370287 SCGB1A1P11684 91 aa6.75□□□□□ -1.33
CSAG1-202ENST00000370287 A8MUN3 132 aa6.74□□□□□ -1.33
CSAG1-202ENST00000370287 K7ERU9 68 aa6.73□□□□□ -1.33
CSAG1-202ENST00000370287 H3BPC8 53 aa6.72□□□□□ -1.33
CSAG1-202ENST00000370287 NDUFC1O43677 76 aa6.71□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.71□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 IMUPQ9GZP8 106 aa6.71□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 MT1BP07438 61 aa6.69□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.67□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.66□□□□□ -1.34
CSAG1-202ENST00000370287 H0YAA0 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 Q5VV11 94 aa6.63□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 DMAC1Q96GE9 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.6□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.59□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 CRIPTQ9P021 101 aa6.59□□□□□ -1.35
CSAG1-202ENST00000370287 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CSAG1-202ENST00000370287 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.57□□□□□ -1.36
CSAG1-202ENST00000370287 SVIPQ8NHG7 77 aa6.55□□□□□ -1.36
CSAG1-202ENST00000370287 A6NN06 94 aa6.52□□□□□ -1.37
CSAG1-202ENST00000370287 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CSAG1-202ENST00000370287 SNURFQ9Y675 71 aa6.5□□□□□ -1.37
CSAG1-202ENST00000370287 P0C880 135 aa6.49□□□□□ -1.37
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP10-5P60370 271 aa6.48□□□□□ -1.37
CSAG1-202ENST00000370287 ACYP2P14621 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.45□□□□□ -1.38
CSAG1-202ENST00000370287 LCE3BQ5TA77 95 aa6.42□□□□□ -1.38
CSAG1-202ENST00000370287 C20orf197Q8N268 126 aa6.42□□□□□ -1.38
CSAG1-202ENST00000370287 SERP2Q8N6R1 65 aa6.42□□□□□ -1.38
CSAG1-202ENST00000370287 R4GN34 69 aa6.39□□□□□ -1.39
CSAG1-202ENST00000370287 M0QZ58 72 aa6.37□□□□□ -1.39
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.37□□□□□ -1.39
CSAG1-202ENST00000370287 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.35□□□□□ -1.39
CSAG1-202ENST00000370287 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.34□□□□□ -1.39
CSAG1-202ENST00000370287 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.32□□□□□ -1.4
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.32□□□□□ -1.4
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.32□□□□□ -1.4
CSAG1-202ENST00000370287 MT1XP80297 61 aa6.29□□□□□ -1.4
CSAG1-202ENST00000370287 PLAC4Q8WY50 150 aa6.29□□□□□ -1.4
CSAG1-202ENST00000370287 LINC01554Q52M75 96 aa6.27□□□□□ -1.41
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.26□□□□□ -1.41
CSAG1-202ENST00000370287 COX7CP15954 63 aa6.26□□□□□ -1.41
CSAG1-202ENST00000370287 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.22□□□□□ -1.41
CSAG1-202ENST00000370287 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.22□□□□□ -1.41
CSAG1-202ENST00000370287 COA5Q86WW8 74 aa6.2□□□□□ -1.42
CSAG1-202ENST00000370287 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.19□□□□□ -1.42
CSAG1-202ENST00000370287 H7BZZ5 65 aa6.17□□□□□ -1.42
CSAG1-202ENST00000370287 KMT2DO14686 5537 aa6.17□□□□□ -1.42
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP5-9P26371 169 aa6.14□□□□□ -1.43
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.13□□□□□ -1.43
CSAG1-202ENST00000370287 NEBP20929 6669 aa6.13□□□□□ -1.43
CSAG1-202ENST00000370287 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.09□□□□□ -1.43
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP12-2P59991 146 aa6.08□□□□□ -1.44
CSAG1-202ENST00000370287 MDN1Q9NU22 5596 aa6.06□□□□□ -1.44
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.05□□□□□ -1.44
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1DQ5T752 114 aa6.03□□□□□ -1.44
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC179H3BU77 68 aa6.01□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.99□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.99□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 SEC61GP60059 68 aa5.98□□□□□ -1.45
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP10-12P60413 245 aa5.95□□□□□ -1.46
CSAG1-202ENST00000370287 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.94□□□□□ -1.46
CSAG1-202ENST00000370287 A0A0D9SG42 100 aa5.92□□□□□ -1.46
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1B0GU33 70 aa5.91□□□□□ -1.46
CSAG1-202ENST00000370287 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.89□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.89□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2EP22531 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2BP35325 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2AP35326 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.85□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1B0GU69 56 aa5.84□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CSAG1-202ENST00000370287 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.82□□□□□ -1.48
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP12-1P59990 96 aa5.81□□□□□ -1.48
CSAG1-202ENST00000370287 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.81□□□□□ -1.48
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.79□□□□□ -1.48
CSAG1-202ENST00000370287 A8MU10 97 aa5.75□□□□□ -1.49
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM258P61165 79 aa5.74□□□□□ -1.49
CSAG1-202ENST00000370287 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.72□□□□□ -1.49
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.71□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.71□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.7□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.7□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 SPRR2DP22532 72 aa5.67□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 PCP4P48539 62 aa5.67□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 PRR15LQ9BU68 103 aa5.67□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 LCE4AQ5TA78 99 aa5.65□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.65□□□□□ -1.5
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.62□□□□□ -1.51
CSAG1-202ENST00000370287 MT1EP04732 61 aa5.57□□□□□ -1.52
CSAG1-202ENST00000370287 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms