RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.32□□□□□ -0.92
SPNS1-202ENST00000323081 MT1HL1P0DM35 61 aa9.28□□□□□ -0.92
SPNS1-202ENST00000323081 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.25□□□□□ -0.93
SPNS1-202ENST00000323081 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SPNS1-202ENST00000323081 XP32Q5T750 250 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS1-202ENST00000323081 H0YAA0 97 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS1-202ENST00000323081 A0A1B0GU33 70 aa9.15□□□□□ -0.94
SPNS1-202ENST00000323081 LINC01554Q52M75 96 aa9.15□□□□□ -0.94
SPNS1-202ENST00000323081 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.13□□□□□ -0.95
SPNS1-202ENST00000323081 CSAG1Q6PB30 78 aa9.1□□□□□ -0.95
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.06□□□□□ -0.96
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.01□□□□□ -0.97
SPNS1-202ENST00000323081 LRP2P98164 4655 aa9.01□□□□□ -0.97
SPNS1-202ENST00000323081 LPAP08519 4548 aa9□□□□□ -0.97
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.98□□□□□ -0.97
SPNS1-202ENST00000323081 TPRXLQ17RH7 258 aa8.96□□□□□ -0.97
SPNS1-202ENST00000323081 K7ERS5 55 aa8.95□□□□□ -0.98
SPNS1-202ENST00000323081 S4R3F8 94 aa8.93□□□□□ -0.98
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SPNS1-202ENST00000323081 HERC2O95714 4834 aa8.8□□□□□ -1
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.8□□□□□ -1
SPNS1-202ENST00000323081 ROMO1P60602 79 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.72□□□□□ -1.01
SPNS1-202ENST00000323081 P0C880 135 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS1-202ENST00000323081 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.7□□□□□ -1.02
SPNS1-202ENST00000323081 J3QL48 77 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS1-202ENST00000323081 A0A0D9SG42 100 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS1-202ENST00000323081 MUC17Q685J3 4493 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS1-202ENST00000323081 CRIPTQ9P021 101 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS1-202ENST00000323081 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS1-202ENST00000323081 M0QZ58 72 aa8.44□□□□□ -1.06
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP12-2P59991 146 aa8.44□□□□□ -1.06
SPNS1-202ENST00000323081 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS1-202ENST00000323081 H3BS24 57 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS1-202ENST00000323081 HERC1Q15751 4861 aa8.4□□□□□ -1.07
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP12-1P59990 96 aa8.39□□□□□ -1.07
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.39□□□□□ -1.07
SPNS1-202ENST00000323081 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.39□□□□□ -1.07
SPNS1-202ENST00000323081 MUC2Q02817 5179 aa8.37□□□□□ -1.07
SPNS1-202ENST00000323081 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.33□□□□□ -1.08
SPNS1-202ENST00000323081 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.33□□□□□ -1.08
SPNS1-202ENST00000323081 R4GN34 69 aa8.29□□□□□ -1.08
SPNS1-202ENST00000323081 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SPNS1-202ENST00000323081 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.11□□□□□ -1.11
SPNS1-202ENST00000323081 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.02□□□□□ -1.13
SPNS1-202ENST00000323081 LCE2CQ5TA81 110 aa7.99□□□□□ -1.13
SPNS1-202ENST00000323081 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS1-202ENST00000323081 NDUFAF8A1L188 74 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS1-202ENST00000323081 RNF213Q63HN8 5207 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS1-202ENST00000323081 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS1-202ENST00000323081 MT1HP80294 61 aa7.78□□□□□ -1.16
SPNS1-202ENST00000323081 M0R2T5 61 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS1-202ENST00000323081 PP632Q6XCG6 107 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS1-202ENST00000323081 PLAC4Q8WY50 150 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.63□□□□□ -1.19
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.61□□□□□ -1.19
SPNS1-202ENST00000323081 MT2AP02795 61 aa7.58□□□□□ -1.2
SPNS1-202ENST00000323081 MT1FP04733 61 aa7.57□□□□□ -1.2
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.57□□□□□ -1.2
SPNS1-202ENST00000323081 TNP1P09430 55 aa7.52□□□□□ -1.2
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP10-10P60014 251 aa7.52□□□□□ -1.2
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.45□□□□□ -1.22
SPNS1-202ENST00000323081 LUZP6Q538Z0 58 aa7.43□□□□□ -1.22
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.34□□□□□ -1.23
SPNS1-202ENST00000323081 MT1BP07438 61 aa7.27□□□□□ -1.25
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.26□□□□□ -1.25
SPNS1-202ENST00000323081 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.19□□□□□ -1.26
SPNS1-202ENST00000323081 LCE3AQ5TA76 89 aa7.15□□□□□ -1.27
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP10-5P60370 271 aa7.14□□□□□ -1.27
SPNS1-202ENST00000323081 MT1XP80297 61 aa7.14□□□□□ -1.27
SPNS1-202ENST00000323081 A0A0A0MQY5 61 aa7.13□□□□□ -1.27
SPNS1-202ENST00000323081 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPNS1-202ENST00000323081 LCE2BO14633 110 aa7.01□□□□□ -1.29
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.96□□□□□ -1.3
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP10-12P60413 245 aa6.94□□□□□ -1.3
SPNS1-202ENST00000323081 USH2AO75445 5202 aa6.93□□□□□ -1.3
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPNS1-202ENST00000323081 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.92□□□□□ -1.3
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP12-3P60328 96 aa6.82□□□□□ -1.32
SPNS1-202ENST00000323081 KMT2DO14686 5537 aa6.64□□□□□ -1.35
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.61□□□□□ -1.35
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.56□□□□□ -1.36
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.56□□□□□ -1.36
SPNS1-202ENST00000323081 SSPOA2VEC9 5147 aa6.54□□□□□ -1.36
SPNS1-202ENST00000323081 INE1O15225 51 aa6.46□□□□□ -1.37
SPNS1-202ENST00000323081 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.41□□□□□ -1.38
SPNS1-202ENST00000323081 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.41□□□□□ -1.38
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.39□□□□□ -1.39
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.38□□□□□ -1.39
SPNS1-202ENST00000323081 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SPNS1-202ENST00000323081 MT1EP04732 61 aa6.2□□□□□ -1.42
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.17□□□□□ -1.42
SPNS1-202ENST00000323081 MT1LQ93083 61 aa6.16□□□□□ -1.42
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.14□□□□□ -1.43
SPNS1-202ENST00000323081 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.11□□□□□ -1.43
SPNS1-202ENST00000323081 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms