RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCE2CQ5TA81 110 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q1T7F1 81 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 V9GYY9 64 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S4R3F8 94 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT1HP80294 61 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCA10Q71F78 164 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.02□□□□□ -0.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10□□□□□ -0.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR15LQ9BU68 103 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R2T5 61 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSPHP1O15172 72 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GU69 56 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSAG1Q6PB30 78 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q5VV11 94 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC61GP60059 68 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H0YAA0 97 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A6NED7 52 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GU33 70 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UQCR11O14957 56 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 P0C880 135 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT2AP02795 61 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRK1Q8WUW1 75 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT1FP04733 61 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-10P60014 251 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A8MU10 97 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0QZ58 72 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO0628Q9UI54 55 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 R4GN34 69 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRIPTQ9P021 101 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0D9SG42 100 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCE2BO14633 110 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC01554Q52M75 96 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USH2AO75445 5202 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 K7ERS5 55 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP12-1P59990 96 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP12-2P59991 146 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A6NN06 94 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PMAIP1Q13794 54 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSPOA2VEC9 5147 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT1BP07438 61 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.81□□□□□ -1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.79□□□□□ -1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLAC4Q8WY50 150 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ROMO1P60602 79 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-5P60370 271 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT1XP80297 61 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SVIPQ8NHG7 77 aa8.43□□□□□ -1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRAC1Q96KF2 57 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNP1P09430 55 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KMT2DO14686 5537 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PP632Q6XCG6 107 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-12P60413 245 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.95□□□□□ -1.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.95□□□□□ -1.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCE3AQ5TA76 89 aa7.92□□□□□ -1.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.92□□□□□ -1.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.82□□□□□ -1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.8□□□□□ -1.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP5-9P26371 169 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.67□□□□□ -1.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.64□□□□□ -1.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP12-3P60328 96 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MDN1Q9NU22 5596 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT1EP04732 61 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms