RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.48□□□□□ -1.37
CTIF-201ENST00000256413 BSNQ9UPA5 3926 aa6.35□□□□□ -1.39
CTIF-201ENST00000256413 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.3□□□□□ -1.4
CTIF-201ENST00000256413 VPS13CQ709C8 3753 aa6.27□□□□□ -1.41
CTIF-201ENST00000256413 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.27□□□□□ -1.41
CTIF-201ENST00000256413 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.26□□□□□ -1.41
CTIF-201ENST00000256413 DNAH2Q9P225 4427 aa6.19□□□□□ -1.42
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.15□□□□□ -1.42
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.13□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.13□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.12□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.12□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.12□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 MT1HP80294 61 aa6.09□□□□□ -1.43
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.08□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 FAT1Q14517 4588 aa6.08□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.07□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.04□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.04□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.03□□□□□ -1.44
CTIF-201ENST00000256413 AKAP9Q99996 3911 aa6.02□□□□□ -1.45
CTIF-201ENST00000256413 MT2AP02795 61 aa5.96□□□□□ -1.46
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2EP22531 72 aa5.95□□□□□ -1.46
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2BP35325 72 aa5.95□□□□□ -1.46
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2AP35326 72 aa5.95□□□□□ -1.46
CTIF-201ENST00000256413 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.89□□□□□ -1.47
CTIF-201ENST00000256413 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CTIF-201ENST00000256413 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.85□□□□□ -1.47
CTIF-201ENST00000256413 MT1FP04733 61 aa5.84□□□□□ -1.47
CTIF-201ENST00000256413 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.83□□□□□ -1.48
CTIF-201ENST00000256413 SPRR2DP22532 72 aa5.82□□□□□ -1.48
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP12-4P60329 112 aa5.78□□□□□ -1.48
CTIF-201ENST00000256413 DNHD1Q96M86 4753 aa5.75□□□□□ -1.49
CTIF-201ENST00000256413 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.73□□□□□ -1.49
CTIF-201ENST00000256413 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CTIF-201ENST00000256413 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CTIF-201ENST00000256413 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.71□□□□□ -1.5
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.67□□□□□ -1.5
CTIF-201ENST00000256413 LCE2BO14633 110 aa5.66□□□□□ -1.5
CTIF-201ENST00000256413 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTIF-201ENST00000256413 ANK2Q01484 3957 aa5.64□□□□□ -1.51
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.64□□□□□ -1.51
CTIF-201ENST00000256413 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.59□□□□□ -1.51
CTIF-201ENST00000256413 MT1XP80297 61 aa5.57□□□□□ -1.52
CTIF-201ENST00000256413 LCE3BQ5TA77 95 aa5.57□□□□□ -1.52
CTIF-201ENST00000256413 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.57□□□□□ -1.52
CTIF-201ENST00000256413 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.49□□□□□ -1.53
CTIF-201ENST00000256413 RYR1P21817 5038 aa5.48□□□□□ -1.53
CTIF-201ENST00000256413 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.47□□□□□ -1.53
CTIF-201ENST00000256413 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
CTIF-201ENST00000256413 HERC1Q15751 4861 aa5.46□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 MT1GP13640 62 aa5.45□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 MYCBP2O75592 4640 aa5.44□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.42□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 MT1BP07438 61 aa5.42□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.42□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.41□□□□□ -1.54
CTIF-201ENST00000256413 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.4□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.4□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 KMT2AQ03164 3969 aa5.38□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 LCE2CQ5TA81 110 aa5.37□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.36□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.36□□□□□ -1.55
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.33□□□□□ -1.56
CTIF-201ENST00000256413 RYR3Q15413 4870 aa5.31□□□□□ -1.56
CTIF-201ENST00000256413 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.29□□□□□ -1.56
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.29□□□□□ -1.56
CTIF-201ENST00000256413 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.26□□□□□ -1.57
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.21□□□□□ -1.57
CTIF-201ENST00000256413 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.21□□□□□ -1.58
CTIF-201ENST00000256413 LYSTQ99698 3801 aa5.2□□□□□ -1.58
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.17□□□□□ -1.58
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.16□□□□□ -1.58
CTIF-201ENST00000256413 PRM1P04553 51 aa5.12□□□□□ -1.59
CTIF-201ENST00000256413 MT1LQ93083 61 aa5.12□□□□□ -1.59
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.08□□□□□ -1.6
CTIF-201ENST00000256413 HSPG2P98160 4391 aa5.07□□□□□ -1.6
CTIF-201ENST00000256413 RYR2Q92736 4967 aa5.06□□□□□ -1.6
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.04□□□□□ -1.6
CTIF-201ENST00000256413 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.02□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 LRP2P98164 4655 aa5.02□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 PKD1P98161 4303 aa5□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 MT1EP04732 61 aa4.99□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.98□□□□□ -1.61
CTIF-201ENST00000256413 MT4P47944 62 aa4.96□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.95□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 HERC2O95714 4834 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.9□□□□□ -1.62
CTIF-201ENST00000256413 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-201ENST00000256413 MUC17Q685J3 4493 aa4.81□□□□□ -1.64
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