RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HOXD11-201ENST00000249504 COA5Q86WW8 74 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.66□□□□□ -0.86
HOXD11-201ENST00000249504 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXD11-201ENST00000249504 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HOXD11-201ENST00000249504 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HOXD11-201ENST00000249504 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD11-201ENST00000249504 S4R3F8 94 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD11-201ENST00000249504 V9GYY9 64 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD11-201ENST00000249504 LCA10Q71F78 164 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD11-201ENST00000249504 Q1T7F1 81 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CSAG1Q6PB30 78 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MT2AP02795 61 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD11-201ENST00000249504 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXD11-201ENST00000249504 PRR15LQ9BU68 103 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXD11-201ENST00000249504 SEC61GP60059 68 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GU69 56 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-10P60014 251 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXD11-201ENST00000249504 MT1FP04733 61 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXD11-201ENST00000249504 PSPHP1O15172 72 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXD11-201ENST00000249504 Q5VV11 94 aa9.1□□□□□ -0.95
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HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXD11-201ENST00000249504 ADM2Q7Z4H4 148 aa9□□□□□ -0.97
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.96□□□□□ -0.97
HOXD11-201ENST00000249504 A6NED7 52 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GU33 70 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXD11-201ENST00000249504 UQCR11O14957 56 aa8.93□□□□□ -0.98
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HOXD11-201ENST00000249504 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD11-201ENST00000249504 CRIPTQ9P021 101 aa8.82□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.81□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 BRK1Q8WUW1 75 aa8.8□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.78□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.78□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.78□□□□□ -1
HOXD11-201ENST00000249504 M0QZ58 72 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD11-201ENST00000249504 USH2AO75445 5202 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD11-201ENST00000249504 R4GN34 69 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXD11-201ENST00000249504 A8MU10 97 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD11-201ENST00000249504 SSPOA2VEC9 5147 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD11-201ENST00000249504 PRO0628Q9UI54 55 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0D9SG42 100 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD11-201ENST00000249504 MT1BP07438 61 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01554Q52M75 96 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD11-201ENST00000249504 K7ERS5 55 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD11-201ENST00000249504 A6NN06 94 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP12-1P59990 96 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 SVIPQ8NHG7 77 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP12-2P59991 146 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 PLAC4Q8WY50 150 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HOXD11-201ENST00000249504 PMAIP1Q13794 54 aa8.34□□□□□ -1.08
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-5P60370 271 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HOXD11-201ENST00000249504 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.16□□□□□ -1.1
HOXD11-201ENST00000249504 MT1XP80297 61 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXD11-201ENST00000249504 ROMO1P60602 79 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXD11-201ENST00000249504 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8□□□□□ -1.13
HOXD11-201ENST00000249504 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.82□□□□□ -1.16
HOXD11-201ENST00000249504 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.79□□□□□ -1.16
HOXD11-201ENST00000249504 TNP1P09430 55 aa7.77□□□□□ -1.17
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HOXD11-201ENST00000249504 PRAC1Q96KF2 57 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-12P60413 245 aa7.73□□□□□ -1.17
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXD11-201ENST00000249504 KMT2DO14686 5537 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.62□□□□□ -1.19
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.62□□□□□ -1.19
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-9P26371 169 aa7.62□□□□□ -1.19
HOXD11-201ENST00000249504 PP632Q6XCG6 107 aa7.55□□□□□ -1.2
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.54□□□□□ -1.2
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.54□□□□□ -1.2
HOXD11-201ENST00000249504 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.45□□□□□ -1.22
HOXD11-201ENST00000249504 LCE3AQ5TA76 89 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2EP22531 72 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2BP35325 72 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2AP35326 72 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD11-201ENST00000249504 NEBP20929 6669 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.26□□□□□ -1.25
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