RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468		F8WEM9	126 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468	ACYP1	P07311	99 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PNM2	257 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468	PDE6G	P18545	87 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468	VPS25	Q9BRG1	176 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468		Q75L30	129 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MUC1-222	ENST00000610468		Q96NJ1	140 aa		7.21	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		7.2	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		7.18	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GV72	72 aa		7.18	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087WSZ3	146 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468	DSCR8	Q96T75	97 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GW54	56 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MUC1-222	ENST00000610468	CCK	P06307	115 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZQT0	140 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	USH2A	O75445	5202 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00643	Q86TS7	51 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468		A8MUU9	505 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MUC1-222	ENST00000610468	SSPO	A2VEC9	5147 aa		7.09	□□□□□ -1.28
MUC1-222	ENST00000610468	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MUC1-222	ENST00000610468	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	MT2A	P02795	61 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	MT-ATP8	P03928	68 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV4-1	P06312	121 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	DSCR10	P59022	87 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	CXCL6	P80162	114 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC1-222	ENST00000610468	MT1F	P04733	61 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZVQ6	151 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GVX0	72 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	HRES1	P13985	223 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00313	P59037	77 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	NREP	Q16612	68 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.92	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	FAM236C	P0DP71	79 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468		J3KT08	172 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.9	□□□□□ -1.3
MUC1-222	ENST00000610468	PCP4	P48539	62 aa		6.89	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		6.89	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		6.88	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468		A8MWP4	228 aa		6.88	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	BPY2	O14599	106 aa		6.86	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-10	P60014	251 aa		6.86	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	PRR15	Q8IV56	129 aa		6.86	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	C8orf87	E5RJ46	101 aa		6.85	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	ATOX1	O00244	68 aa		6.85	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		6.84	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		6.84	□□□□□ -1.31
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	6.83	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		6.83	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468		K7EQZ3	153 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		6.82	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		6.81	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFB1	O75438	58 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.32
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N9L7	120 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087WVE0	104 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	SPINK7	P58062	85 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	UQCRQ	O14949	82 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	SERP2	Q8N6R1	65 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468	hDV103S1	A0JD37	113 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468	COX7C	P15954	63 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468	HCG22	E2RYF7	251 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468		Q5W150	140 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MUC1-222	ENST00000610468	CASC2	Q6XLA1	102 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MUC1-222	ENST00000610468	OCR1	Q9BZK8	76 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFC1	O43677	76 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC179	H3BU77	68 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MUC1-222	ENST00000610468	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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