RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602591.1

HCG18-246, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

Gene HCG18, Length 1,976 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-246ENST00000602591 Q5VSD8 79 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 SPRR4Q96PI1 79 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 SNURFQ9Y675 71 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 A0A0A0MQY5 61 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 LINC00313P59037 77 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 MYCBP2O75592 4640 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 HERC2O95714 4834 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 LINC01554Q52M75 96 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-246ENST00000602591 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.07□□□□□ -1.28
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HCG18-246ENST00000602591 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.06□□□□□ -1.28
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HCG18-246ENST00000602591 LINC00483Q53H64 154 aa7.04□□□□□ -1.28
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HCG18-246ENST00000602591 A0A087X002 238 aa7.04□□□□□ -1.28
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HCG18-246ENST00000602591 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 LIMD2Q9BT23 127 aa7□□□□□ -1.29
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HCG18-246ENST00000602591 LCE2CQ5TA81 110 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 PSPHP1O15172 72 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 Q5VV11 94 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZQT0 140 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-246ENST00000602591 TNXBP22105 4242 aa6.97□□□□□ -1.29
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HCG18-246ENST00000602591 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-246ENST00000602591 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.96□□□□□ -1.3
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HCG18-246ENST00000602591 NREPQ16612 68 aa6.95□□□□□ -1.3
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HCG18-246ENST00000602591 Q75L30 129 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-246ENST00000602591 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.92□□□□□ -1.3
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HCG18-246ENST00000602591 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-246ENST00000602591 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.82□□□□□ -1.32
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HCG18-246ENST00000602591 A0A1B0GW54 56 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-246ENST00000602591 Q8N9L7 120 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-246ENST00000602591 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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HCG18-246ENST00000602591 XP32Q5T750 250 aa6.75□□□□□ -1.33
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HCG18-246ENST00000602591 Q96NJ1 140 aa6.75□□□□□ -1.33
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HCG18-246ENST00000602591 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.71□□□□□ -1.33
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HCG18-246ENST00000602591 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-246ENST00000602591 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.68□□□□□ -1.34
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HCG18-246ENST00000602591 PRAC1Q96KF2 57 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-246ENST00000602591 LINC00208Q96KT6 92 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-246ENST00000602591 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HCG18-246ENST00000602591 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-246ENST00000602591 J3QL48 77 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-246ENST00000602591 K7EQZ3 153 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-246ENST00000602591 LPAP08519 4548 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG18-246ENST00000602591 A8MWP4 228 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-246ENST00000602591 H3BPC8 53 aa6.56□□□□□ -1.36
HCG18-246ENST00000602591 ROMO1P60602 79 aa6.56□□□□□ -1.36
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