RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GW54 56 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 SPINK1P00995 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 LIMD2Q9BT23 127 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PNM2 257 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087WSZ3 146 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 ACYP1P07311 99 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 LCE2BO14633 110 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 K7ERU9 68 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 NREPQ16612 68 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 UBL5Q9BZL1 73 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 M0R2T5 61 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 Q5XG85 94 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00846Q9NV44 126 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZVQ6 151 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-209ENST00000590049 J3KT08 172 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 BPY2O14599 106 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGMAR1Q99720 223 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV4-1P06312 121 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf195Q5TG92 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFB1O75438 58 aa6.42□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00643Q86TS7 51 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 Q96NJ1 140 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-209ENST00000590049 CXCL6P80162 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MWP4 228 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GVX0 72 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-209ENST00000590049 C8orf87E5RJ46 101 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 K7EQZ3 153 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 DSCR10P59022 87 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR15Q8IV56 129 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00313P59037 77 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N9L7 120 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf92A6NGG3 77 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 HCG22E2RYF7 251 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 MT-ATP8P03928 68 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 IMUPQ9GZP8 106 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 hDV103S1A0JD37 113 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 CASC2Q6XLA1 102 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 KMT2DO14686 5537 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087WVE0 104 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFS5O43920 106 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 SCGB1A1P11684 91 aa6.19□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.19□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 XP32Q5T750 250 aa6.17□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.16□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 Q75L30 129 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.15□□□□□ -1.42
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MUU9 505 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 ATOX1O00244 68 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-209ENST00000590049 UQCRQO14949 82 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 PCOTHQ58A44 107 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 MDN1Q9NU22 5596 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 MP68P56378 58 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 OCR1Q9BZK8 76 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 H0Y9P7 68 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 C5orf47Q569G3 176 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 Q5W150 140 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 SERP2Q8N6R1 65 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-209ENST00000590049 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.98□□□□□ -1.45
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