RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563874.5

CLN3-210, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-210ENST00000563874 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.92□□□□□ -1.14
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CLN3-210ENST00000563874 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.91□□□□□ -1.14
CLN3-210ENST00000563874 A0A1B0GVX0 72 aa7.9□□□□□ -1.14
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CLN3-210ENST00000563874 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
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CLN3-210ENST00000563874 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CLN3-210ENST00000563874 RYR2Q92736 4967 aa7.05□□□□□ -1.28
CLN3-210ENST00000563874 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.02□□□□□ -1.29
CLN3-210ENST00000563874 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.02□□□□□ -1.29
CLN3-210ENST00000563874 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.99□□□□□ -1.29
CLN3-210ENST00000563874 LUZP6Q538Z0 58 aa6.98□□□□□ -1.29
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