RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GVX0 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 hDV103S1A0JD37 113 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 NDUFS5O43920 106 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 C1orf195Q5TG92 126 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 HSPG2P98160 4391 aa4.82□□□□□ -1.64
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CS-215ENST00000549143 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 LIMD2Q9BT23 127 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 MYCBP2O75592 4640 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-215ENST00000549143 RYR1P21817 5038 aa4.78□□□□□ -1.64
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CS-215ENST00000549143 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.78□□□□□ -1.65
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CS-215ENST00000549143 LINC00208Q96KT6 92 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 C5orf47Q569G3 176 aa4.76□□□□□ -1.65
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CS-215ENST00000549143 Q8N1X5 172 aa4.75□□□□□ -1.65
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CS-215ENST00000549143 H7BZZ5 65 aa4.75□□□□□ -1.65
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CS-215ENST00000549143 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 C9orf92A6NGG3 77 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 C8orf87E5RJ46 101 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 PRR4Q16378 134 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 TMEM258P61165 79 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 Q5W150 140 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-8P60410 259 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 PCOTHQ58A44 107 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 NDUFC1O43677 76 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 FAM236CP0DP71 79 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 SVIPQ8NHG7 77 aa4.68□□□□□ -1.66
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CS-215ENST00000549143 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CS-215ENST00000549143 TNXBP22105 4242 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 MT1HL1P0DM35 61 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 H3BPC8 53 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 IGKV2-30P06310 120 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-215ENST00000549143 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.6□□□□□ -1.67
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CS-215ENST00000549143 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.59□□□□□ -1.67
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CS-215ENST00000549143 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 J3QL48 77 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 A8MUU9 505 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 HRES1P13985 223 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-215ENST00000549143 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.52□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 C4orf26Q17RF5 130 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 XP32Q5T750 250 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 Q75L30 129 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 SPINK7P58062 85 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 LPAP08519 4548 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 COA5Q86WW8 74 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-215ENST00000549143 LRP2P98164 4655 aa4.48□□□□□ -1.69
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CS-215ENST00000549143 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 ACYP2P14621 99 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 DMAC1Q96GE9 116 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 TPRXLQ17RH7 258 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 HERC1Q15751 4861 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 PSPHP1O15172 72 aa4.4□□□□□ -1.7
CS-215ENST00000549143 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-215ENST00000549143 A8MUN3 132 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-215ENST00000549143 Q1T7F1 81 aa4.34□□□□□ -1.72
CS-215ENST00000549143 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.34□□□□□ -1.72
CS-215ENST00000549143 MUC2Q02817 5179 aa4.34□□□□□ -1.72
CS-215ENST00000549143 PRR15LQ9BU68 103 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-215ENST00000549143 V9GYY9 64 aa4.31□□□□□ -1.72
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