RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542447.6

CADM1-212, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM1, Length 4,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-212ENST00000542447 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 CSAG1Q6PB30 78 aa7.04□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.03□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.02□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.02□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 CRIPTQ9P021 101 aa7.01□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 Q8N1X5 172 aa7□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 PANO1I0J062 215 aa6.99□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.99□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.98□□□□□ -1.29
CADM1-212ENST00000542447 Q5W150 140 aa6.97□□□□□ -1.29
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CADM1-212ENST00000542447 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.95□□□□□ -1.3
CADM1-212ENST00000542447 FAM229AH3BQW9 127 aa6.95□□□□□ -1.3
CADM1-212ENST00000542447 LY6G6CO95867 125 aa6.94□□□□□ -1.3
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CADM1-212ENST00000542447 Q96NJ1 140 aa6.92□□□□□ -1.3
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CADM1-212ENST00000542447 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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CADM1-212ENST00000542447 Q6ZR54 194 aa6.9□□□□□ -1.31
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CADM1-212ENST00000542447 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.87□□□□□ -1.31
CADM1-212ENST00000542447 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.84□□□□□ -1.31
CADM1-212ENST00000542447 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.84□□□□□ -1.31
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CADM1-212ENST00000542447 APLNQ9ULZ1 77 aa6.8□□□□□ -1.32
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CADM1-212ENST00000542447 IGLV7-43P04211 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CADM1-212ENST00000542447 A0A0D9SG42 100 aa6.78□□□□□ -1.32
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CADM1-212ENST00000542447 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.72□□□□□ -1.33
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CADM1-212ENST00000542447 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.67□□□□□ -1.34
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CADM1-212ENST00000542447 LINC00483Q53H64 154 aa6.65□□□□□ -1.35
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.63□□□□□ -1.35
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CADM1-212ENST00000542447 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.59□□□□□ -1.35
CADM1-212ENST00000542447 ANK2Q01484 3957 aa6.57□□□□□ -1.36
CADM1-212ENST00000542447 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.54□□□□□ -1.36
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CADM1-212ENST00000542447 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.51□□□□□ -1.37
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP10-2P60368 255 aa6.51□□□□□ -1.37
CADM1-212ENST00000542447 A8MUU9 505 aa6.49□□□□□ -1.37
CADM1-212ENST00000542447 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.49□□□□□ -1.37
CADM1-212ENST00000542447 Q6ZSA8 131 aa6.49□□□□□ -1.37
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.48□□□□□ -1.37
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CADM1-212ENST00000542447 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.4□□□□□ -1.39
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CADM1-212ENST00000542447 P0C880 135 aa6.3□□□□□ -1.4
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CADM1-212ENST00000542447 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.28□□□□□ -1.4
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CADM1-212ENST00000542447 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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CADM1-212ENST00000542447 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.22□□□□□ -1.41
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CADM1-212ENST00000542447 S4R3F8 94 aa6.2□□□□□ -1.42
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.19□□□□□ -1.42
CADM1-212ENST00000542447 A0A0A0MQY5 61 aa6.13□□□□□ -1.43
CADM1-212ENST00000542447 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CADM1-212ENST00000542447 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.12□□□□□ -1.43
CADM1-212ENST00000542447 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.12□□□□□ -1.43
CADM1-212ENST00000542447 TPRXLQ17RH7 258 aa6.11□□□□□ -1.43
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.1□□□□□ -1.43
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CADM1-212ENST00000542447 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CADM1-212ENST00000542447 M0QZ58 72 aa6.03□□□□□ -1.44
CADM1-212ENST00000542447 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.03□□□□□ -1.44
CADM1-212ENST00000542447 R4GN34 69 aa6.02□□□□□ -1.45
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CADM1-212ENST00000542447 KMT2AQ03164 3969 aa6□□□□□ -1.45
CADM1-212ENST00000542447 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.99□□□□□ -1.45
CADM1-212ENST00000542447 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.98□□□□□ -1.45
CADM1-212ENST00000542447 RYR3Q15413 4870 aa5.98□□□□□ -1.45
CADM1-212ENST00000542447 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.97□□□□□ -1.45
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP12-2P59991 146 aa5.95□□□□□ -1.46
CADM1-212ENST00000542447 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.95□□□□□ -1.46
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.93□□□□□ -1.46
CADM1-212ENST00000542447 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.93□□□□□ -1.46
CADM1-212ENST00000542447 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.92□□□□□ -1.46
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