RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.09□□□□□ -1.75
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.09□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.09□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q5W150 140 aa4.09□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.09□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.09□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BPC8 53 aa4.08□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q75L30 129 aa4.08□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.08□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 APLNQ9ULZ1 77 aa4.08□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.07□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.07□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.06□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZR54 194 aa4.06□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 A6NN06 94 aa4.06□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.05□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.05□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1B0GVX0 72 aa4.05□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.05□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.04□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.03□□□□□ -1.76
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.02□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.02□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.02□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00483Q53H64 154 aa4.02□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNHD1Q96M86 4753 aa4.02□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.01□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 C14orf177Q52M58 125 aa4.01□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADM2Q7Z4H4 148 aa4□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.99□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK2AP2O75956 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRAC1Q96KF2 57 aa3.99□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 PKD1P98161 4303 aa3.98□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A087WTM6 91 aa3.98□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 C8orf87E5RJ46 101 aa3.98□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.98□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF861PO60384 105 aa3.97□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 RTL8CO15255 209 aa3.97□□□□□ -1.77
RAPGEF6-211ENST00000512611 PKHD1P08F94 4074 aa3.95□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00313P59037 77 aa3.94□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACYP2P14621 99 aa3.92□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV7-43P04211 117 aa3.91□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC01554Q52M75 96 aa3.91□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 DMAC1Q96GE9 116 aa3.9□□□□□ -1.78
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.9□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1B0GU69 56 aa3.89□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP10-2P60368 255 aa3.89□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.88□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGKV2-30P06310 120 aa3.88□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAT1Q14517 4588 aa3.88□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUPR2A6NF83 97 aa3.88□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.87□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPINK1P00995 79 aa3.86□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.85□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM229AH3BQW9 127 aa3.84□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q8N1X5 172 aa3.84□□□□□ -1.79
RAPGEF6-211ENST00000512611 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.84□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.83□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.83□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 LY6G6CO95867 125 aa3.82□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.82□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.81□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP10-1P60331 282 aa3.81□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 UQCR11O14957 56 aa3.8□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSAG1Q6PB30 78 aa3.8□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.77□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYCBP2O75592 4640 aa3.77□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.76□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZSA8 131 aa3.76□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPG2P98160 4391 aa3.76□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 H0YAA0 97 aa3.75□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0A0MQY5 61 aa3.74□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.74□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.74□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 C9orf92A6NGG3 77 aa3.74□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRIPTQ9P021 101 aa3.73□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 LPAP08519 4548 aa3.71□□□□□ -1.81
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7ERS5 55 aa3.71□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.69□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 A8MUU9 505 aa3.68□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.68□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.65□□□□□ -1.82
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.65□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.5 ms