RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 IGFL1Q6UW32 110 aa3.63□□□□□ -1.83
C6orf48-208ENST00000395788 F8WEM9 126 aa3.62□□□□□ -1.83
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C6orf48-208ENST00000395788 CXCL6P80162 114 aa3.62□□□□□ -1.83
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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C6orf48-208ENST00000395788 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
C6orf48-208ENST00000395788 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM236CP0DP71 79 aa3.58□□□□□ -1.84
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.56□□□□□ -1.84
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087WSZ3 146 aa3.55□□□□□ -1.84
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C6orf48-208ENST00000395788 DSCR10P59022 87 aa3.55□□□□□ -1.84
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C6orf48-208ENST00000395788 MOBPQ13875 183 aa3.54□□□□□ -1.84
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C6orf48-208ENST00000395788 CCDC179H3BU77 68 aa3.48□□□□□ -1.85
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C6orf48-208ENST00000395788 Q5VSD8 79 aa3.4□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.4□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf197Q8N268 126 aa3.4□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.4□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 MT3P25713 68 aa3.39□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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C6orf48-208ENST00000395788 H7BZZ5 65 aa3.38□□□□□ -1.87
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