RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GVX0 72 aa8.47□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 TNP2Q05952 138 aa8.46□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 A0A0D9SG42 100 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-202ENST00000382998 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-202ENST00000382998 FAM168BA1KXE4 195 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-202ENST00000382998 C15orf56Q8N910 161 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-202ENST00000382998 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-202ENST00000382998 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 Q8NDZ9 215 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 CUBNO60494 3623 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.3□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.3□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 Q8N1X5 172 aa8.29□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.29□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 Q5W150 140 aa8.28□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.27□□□□□ -1.08
CTIF-202ENST00000382998 ZFHX3Q15911 3703 aa8.27□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 BSNQ9UPA5 3926 aa8.25□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.25□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 PDZD2O15018 2839 aa8.21□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CTIF-202ENST00000382998 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 TENM3Q9P273 2699 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 P0C880 135 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 Q96NJ1 140 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-202ENST00000382998 PANO1I0J062 215 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-202ENST00000382998 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-202ENST00000382998 TENM2Q9NT68 2774 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-2P60368 255 aa8.1□□□□□ -1.11
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.1□□□□□ -1.11
CTIF-202ENST00000382998 TGP01266 2768 aa8.07□□□□□ -1.12
CTIF-202ENST00000382998 VWFP04275 2813 aa8.07□□□□□ -1.12
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-1P60331 282 aa8.04□□□□□ -1.12
CTIF-202ENST00000382998 Q5VSD8 79 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-202ENST00000382998 C9orf92A6NGG3 77 aa7.99□□□□□ -1.13
CTIF-202ENST00000382998 SPRR1AP35321 89 aa7.97□□□□□ -1.13
CTIF-202ENST00000382998 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-202ENST00000382998 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-202ENST00000382998 VPS13CQ709C8 3753 aa7.91□□□□□ -1.14
CTIF-202ENST00000382998 PLAC4Q8WY50 150 aa7.89□□□□□ -1.15
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZSA8 131 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.8□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 H0YAA0 97 aa7.8□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 SPRR1BP22528 89 aa7.78□□□□□ -1.16
CTIF-202ENST00000382998 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-202ENST00000382998 R4GN34 69 aa7.65□□□□□ -1.18
CTIF-202ENST00000382998 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CTIF-202ENST00000382998 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-202ENST00000382998 M0R2T5 61 aa7.6□□□□□ -1.19
CTIF-202ENST00000382998 FBN3Q75N90 2809 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-202ENST00000382998 TPRXLQ17RH7 258 aa7.57□□□□□ -1.2
CTIF-202ENST00000382998 S4R3F8 94 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.47□□□□□ -1.21
CTIF-202ENST00000382998 COL7A1Q02388 2944 aa7.46□□□□□ -1.22
CTIF-202ENST00000382998 PP632Q6XCG6 107 aa7.41□□□□□ -1.22
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-8P60410 259 aa7.37□□□□□ -1.23
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.37□□□□□ -1.23
CTIF-202ENST00000382998 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.37□□□□□ -1.23
CTIF-202ENST00000382998 AKAP9Q99996 3911 aa7.35□□□□□ -1.23
CTIF-202ENST00000382998 M0QZ58 72 aa7.29□□□□□ -1.24
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.24□□□□□ -1.25
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GVY2 172 aa7.24□□□□□ -1.25
CTIF-202ENST00000382998 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.19□□□□□ -1.26
CTIF-202ENST00000382998 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.17□□□□□ -1.26
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.17□□□□□ -1.26
CTIF-202ENST00000382998 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.14□□□□□ -1.27
CTIF-202ENST00000382998 INE1O15225 51 aa7.11□□□□□ -1.27
CTIF-202ENST00000382998 DNHD1Q96M86 4753 aa7.11□□□□□ -1.27
CTIF-202ENST00000382998 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP12-2P59991 146 aa6.96□□□□□ -1.3
CTIF-202ENST00000382998 XP32Q5T750 250 aa6.94□□□□□ -1.3
CTIF-202ENST00000382998 TNP1P09430 55 aa6.92□□□□□ -1.3
CTIF-202ENST00000382998 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.82□□□□□ -1.32
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP12-1P59990 96 aa6.81□□□□□ -1.32
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.81□□□□□ -1.32
CTIF-202ENST00000382998 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.78□□□□□ -1.32
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.74□□□□□ -1.33
CTIF-202ENST00000382998 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTIF-202ENST00000382998 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CTIF-202ENST00000382998 ANK2Q01484 3957 aa6.69□□□□□ -1.34
CTIF-202ENST00000382998 MT1HL1P0DM35 61 aa6.62□□□□□ -1.35
CTIF-202ENST00000382998 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.62□□□□□ -1.35
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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