RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf64Q8NEQ6 169 aa12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP1BQ9NZR2 4599 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 CD164Q04900 197 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR4Q16378 134 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A087X002 238 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK2AP2O75956 126 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-202ENST00000335475 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa12.15□□□□□ -0.47
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-202ENST00000335475 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-202ENST00000335475 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 PMAIP1Q13794 54 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFS5O43920 106 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 SACSQ9NZJ4 4579 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.99□□□□□ -0.49
KCNQ1-202ENST00000335475 Q1T7F1 81 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-202ENST00000335475 PCOTHQ58A44 107 aa11.98□□□□□ -0.49
KCNQ1-202ENST00000335475 C8orf87E5RJ46 101 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.96□□□□□ -0.49
KCNQ1-202ENST00000335475 Q5W150 140 aa11.93□□□□□ -0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PKHD1P08F94 4074 aa11.91□□□□□ -0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.86□□□□□ -0.51
KCNQ1-202ENST00000335475 COA5Q86WW8 74 aa11.86□□□□□ -0.51
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00313P59037 77 aa11.85□□□□□ -0.51
KCNQ1-202ENST00000335475 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
KCNQ1-202ENST00000335475 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
KCNQ1-202ENST00000335475 LIMD2Q9BT23 127 aa11.83□□□□□ -0.52
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa11.81□□□□□ -0.52
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
KCNQ1-202ENST00000335475 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.78□□□□□ -0.52
KCNQ1-202ENST00000335475 PSPHP1O15172 72 aa11.77□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM229AH3BQW9 127 aa11.74□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GVY2 172 aa11.73□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 A8MUN3 132 aa11.72□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SPINK1P00995 79 aa11.72□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 HRES1P13985 223 aa11.72□□□□□ -0.53
KCNQ1-202ENST00000335475 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.71□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 Q5VV11 94 aa11.69□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.68□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV2-30P06310 120 aa11.66□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.66□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 FAT1Q14517 4588 aa11.65□□□□□ -0.54
KCNQ1-202ENST00000335475 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa11.65□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 RYR2Q92736 4967 aa11.64□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.64□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR15LQ9BU68 103 aa11.61□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.59□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.59□□□□□ -0.55
KCNQ1-202ENST00000335475 DMAC1Q96GE9 116 aa11.58□□□□□ -0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.57□□□□□ -0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.56□□□□□ -0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 Q75L30 129 aa11.53□□□□□ -0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ACYP2P14621 99 aa11.52□□□□□ -0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.5□□□□□ -0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.47□□□□□ -0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 A8MU10 97 aa11.45□□□□□ -0.58
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.35□□□□□ -0.59
KCNQ1-202ENST00000335475 A6NED7 52 aa11.34□□□□□ -0.59
KCNQ1-202ENST00000335475 LCA10Q71F78 164 aa11.34□□□□□ -0.59
KCNQ1-202ENST00000335475 C7orf65Q6ZTY9 151 aa11.34□□□□□ -0.59
KCNQ1-202ENST00000335475 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.33□□□□□ -0.6
KCNQ1-202ENST00000335475 A8MUU9 505 aa11.33□□□□□ -0.6
KCNQ1-202ENST00000335475 C9orf92A6NGG3 77 aa11.31□□□□□ -0.6
KCNQ1-202ENST00000335475 A6NN06 94 aa11.31□□□□□ -0.6
KCNQ1-202ENST00000335475 SPINK7P58062 85 aa11.28□□□□□ -0.6
KCNQ1-202ENST00000335475 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.26□□□□□ -0.61
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11.26□□□□□ -0.61
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPG2P98160 4391 aa11.25□□□□□ -0.61
KCNQ1-202ENST00000335475 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
KCNQ1-202ENST00000335475 TNXBP22105 4242 aa11.24□□□□□ -0.61
KCNQ1-202ENST00000335475 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.21□□□□□ -0.62
KCNQ1-202ENST00000335475 Q8N1X5 172 aa11.18□□□□□ -0.62
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
KCNQ1-202ENST00000335475 RYR3Q15413 4870 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GU69 56 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP10-8P60410 259 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 Q5VSD8 79 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 RYR1P21817 5038 aa11.12□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BS24 57 aa11.11□□□□□ -0.63
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.06□□□□□ -0.64
KCNQ1-202ENST00000335475 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.04□□□□□ -0.64
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.94□□□□□ -0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 UQCR11O14957 56 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-202ENST00000335475 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01554Q52M75 96 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 MT1HL1P0DM35 61 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.6 ms