RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.9□□□□□ -0.02
PKDCC-201ENST00000294964 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.88□□□□□ -0.03
PKDCC-201ENST00000294964 Q96NJ1 140 aa14.88□□□□□ -0.03
PKDCC-201ENST00000294964 C8orf17Q9NRJ1 99 aa14.87□□□□□ -0.03
PKDCC-201ENST00000294964 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.86□□□□□ -0.03
PKDCC-201ENST00000294964 PRR26Q8N8Z3 221 aa14.85□□□□□ -0.03
PKDCC-201ENST00000294964 C14orf177Q52M58 125 aa14.83□□□□□ -0.04
PKDCC-201ENST00000294964 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.83□□□□□ -0.04
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PKDCC-201ENST00000294964 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa14.77□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 KMT2AQ03164 3969 aa14.77□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.71□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.71□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GVX0 72 aa14.71□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKDCC-201ENST00000294964 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.68□□□□□ -0.06
PKDCC-201ENST00000294964 LINC01554Q52M75 96 aa14.67□□□□□ -0.06
PKDCC-201ENST00000294964 A0A087X002 238 aa14.66□□□□□ -0.06
PKDCC-201ENST00000294964 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa14.66□□□□□ -0.06
PKDCC-201ENST00000294964 LY6G6CO95867 125 aa14.64□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.64□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH2Q9P225 4427 aa14.64□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.62□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.62□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa14.62□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.62□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 ANAPC11Q9NYG5 84 aa14.62□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 A0A087WTM6 91 aa14.6□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 CDK2AP2O75956 126 aa14.59□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.59□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 Q5W150 140 aa14.59□□□□□ -0.07
PKDCC-201ENST00000294964 ACYP2P14621 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PKDCC-201ENST00000294964 RTL8CO15255 209 aa14.57□□□□□ -0.08
PKDCC-201ENST00000294964 H3BS24 57 aa14.52□□□□□ -0.08
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa14.52□□□□□ -0.08
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA8Q6RVD6 105 aa14.52□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.51□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GU69 56 aa14.51□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.51□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.47□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PKDCC-201ENST00000294964 DMAC1Q96GE9 116 aa14.44□□□□□ -0.1
PKDCC-201ENST00000294964 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.4□□□□□ -0.1
PKDCC-201ENST00000294964 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.4□□□□□ -0.1
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00483Q53H64 154 aa14.4□□□□□ -0.1
PKDCC-201ENST00000294964 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.38□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 RYR2Q92736 4967 aa14.36□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.36□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 CSAG1Q6PB30 78 aa14.35□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.34□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 UQCR11O14957 56 aa14.34□□□□□ -0.11
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF861PO60384 105 aa14.31□□□□□ -0.12
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.27□□□□□ -0.12
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PKDCC-201ENST00000294964 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.24□□□□□ -0.13
PKDCC-201ENST00000294964 PKD1P98161 4303 aa14.21□□□□□ -0.13
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP10-2P60368 255 aa14.2□□□□□ -0.14
PKDCC-201ENST00000294964 RYR3Q15413 4870 aa14.2□□□□□ -0.14
PKDCC-201ENST00000294964 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.2□□□□□ -0.14
PKDCC-201ENST00000294964 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.2□□□□□ -0.14
PKDCC-201ENST00000294964 IGLV7-43P04211 117 aa14.17□□□□□ -0.14
PKDCC-201ENST00000294964 IGKV2-30P06310 120 aa14.13□□□□□ -0.15
PKDCC-201ENST00000294964 FAM229AH3BQW9 127 aa14.11□□□□□ -0.15
PKDCC-201ENST00000294964 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.05□□□□□ -0.16
PKDCC-201ENST00000294964 PKHD1P08F94 4074 aa14.05□□□□□ -0.16
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP10-1P60331 282 aa13.98□□□□□ -0.17
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GVY2 172 aa13.94□□□□□ -0.18
PKDCC-201ENST00000294964 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa13.91□□□□□ -0.18
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa13.91□□□□□ -0.18
PKDCC-201ENST00000294964 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PKDCC-201ENST00000294964 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa13.87□□□□□ -0.19
PKDCC-201ENST00000294964 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.85□□□□□ -0.19
PKDCC-201ENST00000294964 SPINK1P00995 79 aa13.84□□□□□ -0.19
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa13.83□□□□□ -0.2
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa13.81□□□□□ -0.2
PKDCC-201ENST00000294964 A8MUU9 505 aa13.8□□□□□ -0.2
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZSA8 131 aa13.79□□□□□ -0.2
PKDCC-201ENST00000294964 ROMO1P60602 79 aa13.75□□□□□ -0.21
PKDCC-201ENST00000294964 H0YAA0 97 aa13.74□□□□□ -0.21
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.72□□□□□ -0.21
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa13.72□□□□□ -0.21
PKDCC-201ENST00000294964 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PKDCC-201ENST00000294964 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PKDCC-201ENST00000294964 Q8N1X5 172 aa13.68□□□□□ -0.22
PKDCC-201ENST00000294964 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.57□□□□□ -0.24
PKDCC-201ENST00000294964 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PKDCC-201ENST00000294964 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PKDCC-201ENST00000294964 FAT1Q14517 4588 aa13.51□□□□□ -0.25
PKDCC-201ENST00000294964 CRIPTQ9P021 101 aa13.49□□□□□ -0.25
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GU33 70 aa13.49□□□□□ -0.25
PKDCC-201ENST00000294964 HSPG2P98160 4391 aa13.48□□□□□ -0.25
PKDCC-201ENST00000294964 RYR1P21817 5038 aa13.43□□□□□ -0.26
PKDCC-201ENST00000294964 P0C880 135 aa13.43□□□□□ -0.26
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.43□□□□□ -0.26
PKDCC-201ENST00000294964 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.41□□□□□ -0.26
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.29□□□□□ -0.28
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf92A6NGG3 77 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms