RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-201ENST00000256413 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-201ENST00000256413 HIVEP1P15822 2718 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-201ENST00000256413 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTIF-201ENST00000256413 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-201ENST00000256413 ITPR2Q14571 2701 aa8.28□□□□□ -1.08
CTIF-201ENST00000256413 TACC2O95359 2948 aa8.28□□□□□ -1.08
CTIF-201ENST00000256413 TPRXLQ17RH7 258 aa8.27□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.25□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 ZZEF1O43149 2961 aa8.25□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 XP32Q5T750 250 aa8.24□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 REV3LO60673 3130 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 ATMQ13315 3056 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-201ENST00000256413 LAMA1P25391 3075 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 VCANP13611 3396 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 FRYLO94915 3013 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.19□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP12-2P59991 146 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 CDH23Q9H251 3354 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 COL12A1Q99715 3063 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-201ENST00000256413 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
CTIF-201ENST00000256413 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-201ENST00000256413 TGP01266 2768 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-201ENST00000256413 FLNCQ14315 2725 aa8.09□□□□□ -1.12
CTIF-201ENST00000256413 COL6A3P12111 3177 aa8.05□□□□□ -1.12
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-10P60014 251 aa8.04□□□□□ -1.12
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP12-1P59990 96 aa8.04□□□□□ -1.12
CTIF-201ENST00000256413 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.03□□□□□ -1.12
CTIF-201ENST00000256413 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8□□□□□ -1.13
CTIF-201ENST00000256413 SZT2Q5T011 3432 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GVY2 172 aa7.96□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 ZANQ9Y493 2812 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.91□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.91□□□□□ -1.14
CTIF-201ENST00000256413 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTIF-201ENST00000256413 FBN2P35556 2912 aa7.85□□□□□ -1.15
CTIF-201ENST00000256413 NF1P21359 2839 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTIF-201ENST00000256413 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-201ENST00000256413 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CTIF-201ENST00000256413 TENM3Q9P273 2699 aa7.71□□□□□ -1.17
CTIF-201ENST00000256413 TENM4Q6N022 2769 aa7.71□□□□□ -1.17
CTIF-201ENST00000256413 SPEGQ15772 3267 aa7.7□□□□□ -1.18
CTIF-201ENST00000256413 INE1O15225 51 aa7.7□□□□□ -1.18
CTIF-201ENST00000256413 EYSQ5T1H1 3165 aa7.66□□□□□ -1.18
CTIF-201ENST00000256413 TENM2Q9NT68 2774 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-201ENST00000256413 PDZD2O15018 2839 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-201ENST00000256413 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-201ENST00000256413 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.6□□□□□ -1.19
CTIF-201ENST00000256413 USP34Q70CQ2 3546 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-201ENST00000256413 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-201ENST00000256413 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.39□□□□□ -1.23
CTIF-201ENST00000256413 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.38□□□□□ -1.23
CTIF-201ENST00000256413 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.36□□□□□ -1.23
CTIF-201ENST00000256413 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.36□□□□□ -1.23
CTIF-201ENST00000256413 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.31□□□□□ -1.24
CTIF-201ENST00000256413 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTIF-201ENST00000256413 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.26□□□□□ -1.25
CTIF-201ENST00000256413 VWFP04275 2813 aa7.18□□□□□ -1.26
CTIF-201ENST00000256413 FBN3Q75N90 2809 aa7.17□□□□□ -1.26
CTIF-201ENST00000256413 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.17□□□□□ -1.26
CTIF-201ENST00000256413 RELNP78509 3460 aa7.14□□□□□ -1.27
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.13□□□□□ -1.27
CTIF-201ENST00000256413 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.13□□□□□ -1.27
CTIF-201ENST00000256413 ZFHX3Q15911 3703 aa7.06□□□□□ -1.28
CTIF-201ENST00000256413 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.05□□□□□ -1.28
CTIF-201ENST00000256413 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.05□□□□□ -1.28
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-12P60413 245 aa7□□□□□ -1.29
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP12-3P60328 96 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-201ENST00000256413 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTIF-201ENST00000256413 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTIF-201ENST00000256413 LCE3AQ5TA76 89 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-201ENST00000256413 LAMA5O15230 3695 aa6.89□□□□□ -1.31
CTIF-201ENST00000256413 COL7A1Q02388 2944 aa6.87□□□□□ -1.31
CTIF-201ENST00000256413 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CTIF-201ENST00000256413 MT1HL1P0DM35 61 aa6.81□□□□□ -1.32
CTIF-201ENST00000256413 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.8□□□□□ -1.32
CTIF-201ENST00000256413 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTIF-201ENST00000256413 DMDP11532 3685 aa6.78□□□□□ -1.32
CTIF-201ENST00000256413 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-201ENST00000256413 CUBNO60494 3623 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-201ENST00000256413 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.72□□□□□ -1.33
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.65□□□□□ -1.35
CTIF-201ENST00000256413 MUC3AQ02505 3323 aa6.58□□□□□ -1.36
CTIF-201ENST00000256413 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTIF-201ENST00000256413 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.55□□□□□ -1.36
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.54□□□□□ -1.36
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-5P60370 271 aa6.53□□□□□ -1.36
CTIF-201ENST00000256413 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.52□□□□□ -1.37
CTIF-201ENST00000256413 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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