RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 STAB1Q9NY15 2570 aa3.82□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.82□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0G2JQZ4 141 aa3.81□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 A6NN06 94 aa3.8□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 CASC10Q5T4H9 136 aa3.8□□□□□ -1.8
SCN2A-209ENST00000636071 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-3P60369 221 aa3.77□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 TNP1P09430 55 aa3.75□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.75□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.74□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 MAST4O15021 2626 aa3.74□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.74□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.73□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.72□□□□□ -1.81
SCN2A-209ENST00000636071 Q8NDZ9 215 aa3.71□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.71□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 Q5VSD8 79 aa3.7□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.7□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 ATRQ13535 2644 aa3.69□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.69□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 CENPEQ02224 2701 aa3.68□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 A8MUU9 505 aa3.67□□□□□ -1.82
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.64□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFAF8A1L188 74 aa3.63□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.63□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 ITPR3Q14573 2671 aa3.62□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-1P60331 282 aa3.59□□□□□ -1.83
SCN2A-209ENST00000636071 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.58□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.58□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.57□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.56□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 NOTCH1P46531 2555 aa3.55□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 P0C880 135 aa3.54□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.54□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.53□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.53□□□□□ -1.84
SCN2A-209ENST00000636071 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-2P60368 255 aa3.51□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 A8MU10 97 aa3.49□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 COL6A5A8TX70 2615 aa3.49□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 BPTFQ12830 3046 aa3.47□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.46□□□□□ -1.86
SCN2A-209ENST00000636071 AKAP13Q12802 2813 aa3.46□□□□□ -1.86
SCN2A-209ENST00000636071 TPRXLQ17RH7 258 aa3.45□□□□□ -1.86
SCN2A-209ENST00000636071 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SCN2A-209ENST00000636071 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.39□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.39□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 CHD6Q8TD26 2715 aa3.39□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 H0YAA0 97 aa3.38□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.36□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-8P60410 259 aa3.36□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 INE1O15225 51 aa3.35□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 XP32Q5T750 250 aa3.35□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SCN2A-209ENST00000636071 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.31□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF292O60281 2723 aa3.31□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.31□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 ITPR2Q14571 2701 aa3.3□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.29□□□□□ -1.88
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.25□□□□□ -1.89
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-10P60014 251 aa3.22□□□□□ -1.89
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.2□□□□□ -1.9
SCN2A-209ENST00000636071 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.18□□□□□ -1.9
SCN2A-209ENST00000636071 APCP25054 2843 aa3.15□□□□□ -1.9
SCN2A-209ENST00000636071 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.15□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.14□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP12-2P59991 146 aa3.14□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 TENM3Q9P273 2699 aa3.13□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 HIVEP1P15822 2718 aa3.12□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP12-1P59990 96 aa3.11□□□□□ -1.91
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.08□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 CENPFP49454 3210 aa3.08□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 ITPR1Q14643 2758 aa3.07□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GVY2 172 aa3.03□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 TGP01266 2768 aa3.03□□□□□ -1.92
SCN2A-209ENST00000636071 MGAQ8IWI9 3026 aa3.02□□□□□ -1.93
SCN2A-209ENST00000636071 TENM4Q6N022 2769 aa2.99□□□□□ -1.93
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.97□□□□□ -1.93
SCN2A-209ENST00000636071 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.96□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 KALRNO60229 2985 aa2.95□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 FLNCQ14315 2725 aa2.95□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP10-12P60413 245 aa2.93□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.91□□□□□ -1.94
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.9□□□□□ -1.95
SCN2A-209ENST00000636071 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
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