RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, human

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALMS1-208	ENST00000620466	OXT	P01178	125 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	COL6A3	P12111	3177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	ACAN	P16112	2415 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	MTOR	P42345	2549 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	JMJD1C	Q15652	2540 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	SPEG	Q15772	3267 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ALMS1-208	ENST00000620466	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466		S4R3F8	94 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	EYS	Q5T1H1	3165 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	SPRR1B	P22528	89 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	FRY	Q5TBA9	3013 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466		Q75L30	129 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	HRES1	P13985	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF292	O60281	2723 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	FRYL	O94915	3013 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ALMS1-208	ENST00000620466		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466		A0A1B0GU33	70 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466		Q5VV11	94 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466		Q5VSD8	79 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ALMS1-208	ENST00000620466	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	ITPR3	Q14573	2671 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	LRBA	P50851	2863 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466		Q5W150	140 aa		5	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		5	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	PANO1	I0J062	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	SPINK7	P58062	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	KALRN	O60229	2985 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	F8	P00451	2351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALMS1-208	ENST00000620466		R4GN34	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466		Q6ZR54	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	LCE6A	A0A183	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ALMS1-208	ENST00000620466		A0A087X002	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466		M0QZ58	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ATM	Q13315	3056 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ATR	Q13535	2644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ROMO1	P60602	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ALMS1-208	ENST00000620466	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	DMD	P11532	3685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	TACC2	O95359	2948 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	CENPE	Q02224	2701 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466		A8MU10	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ALMS1-208	ENST00000620466	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466		A6NN06	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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