RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.3□□□□□ -1.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.28□□□□□ -1.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPRR1BP22528 89 aa8.27□□□□□ -1.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 ROMO1P60602 79 aa8.26□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q8NDZ9 215 aa8.26□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE6AA0A183 80 aa8.25□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 M0QZ58 72 aa8.25□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITPR3Q14573 2671 aa8.23□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 UTRNP46939 3433 aa8.23□□□□□ -1.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP10-1P60331 282 aa8.2□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.19□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.18□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 AKAP13Q12802 2813 aa8.18□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP10-2P60368 255 aa8.17□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 OXTP01178 125 aa8.17□□□□□ -1.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.14□□□□□ -1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.13□□□□□ -1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.13□□□□□ -1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.09□□□□□ -1.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.06□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.06□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.05□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q6ZR54 194 aa8.04□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOTCH1P46531 2555 aa8.03□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.03□□□□□ -1.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHD6Q8TD26 2715 aa8.01□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.98□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 PANO1I0J062 215 aa7.98□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 CENPEQ02224 2701 aa7.96□□□□□ -1.13
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.93□□□□□ -1.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.92□□□□□ -1.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 PCNTO95613 3336 aa7.91□□□□□ -1.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A087X002 238 aa7.88□□□□□ -1.15
SLC35E2B-205ENST00000617444 CEP350Q5VT06 3117 aa7.86□□□□□ -1.15
SLC35E2B-205ENST00000617444 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.86□□□□□ -1.15
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.86□□□□□ -1.15
SLC35E2B-205ENST00000617444 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.85□□□□□ -1.15
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.83□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 A8MUU9 505 aa7.82□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 COL6A5A8TX70 2615 aa7.82□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 A8MU10 97 aa7.81□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 A6NN06 94 aa7.79□□□□□ -1.16
SLC35E2B-205ENST00000617444 NDUFAF8A1L188 74 aa7.75□□□□□ -1.17
SLC35E2B-205ENST00000617444 C5orf42Q9H799 3197 aa7.73□□□□□ -1.17
SLC35E2B-205ENST00000617444 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNP1P09430 55 aa7.64□□□□□ -1.19
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.64□□□□□ -1.19
SLC35E2B-205ENST00000617444 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.61□□□□□ -1.19
SLC35E2B-205ENST00000617444 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.58□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF292O60281 2723 aa7.58□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.57□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 BRCA2P51587 3418 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A1B0GVY2 172 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.53□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.53□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP10-8P60410 259 aa7.52□□□□□ -1.21
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A0C4DFX4 3053 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFAP54Q96N23 3096 aa7.46□□□□□ -1.21
SLC35E2B-205ENST00000617444 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SLC35E2B-205ENST00000617444 PP632Q6XCG6 107 aa7.44□□□□□ -1.22
SLC35E2B-205ENST00000617444 HTTP42858 3142 aa7.44□□□□□ -1.22
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.42□□□□□ -1.22
SLC35E2B-205ENST00000617444 MGAQ8IWI9 3026 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP10-10P60014 251 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 FRYQ5TBA9 3013 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC35E2B-205ENST00000617444 LAMA3Q16787 3333 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDH23Q9H251 3354 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITPR2Q14571 2701 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC35E2B-205ENST00000617444 XP32Q5T750 250 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 P0C880 135 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 APCP25054 2843 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.21□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITPR1Q14643 2758 aa7.21□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 SZT2Q5T011 3432 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 H0YAA0 97 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 HIVEP1P15822 2718 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms