RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRM-211ENST00000580170 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PTPRM-211ENST00000580170 RPL37P61927 97 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PTPRM-211ENST00000580170 M0R2T5 61 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRM-211ENST00000580170 UTRNP46939 3433 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf42Q9H799 3197 aa12.77□□□□□ -0.36
PTPRM-211ENST00000580170 CEP350Q5VT06 3117 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRM-211ENST00000580170 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRM-211ENST00000580170 ITPR3Q14573 2671 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRM-211ENST00000580170 R4GN34 69 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRM-211ENST00000580170 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRM-211ENST00000580170 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PTPRM-211ENST00000580170 A6NN06 94 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP10-1P60331 282 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZR54 194 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 ATRQ13535 2644 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP10-2P60368 255 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA8Q6RVD6 105 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PTPRM-211ENST00000580170 Q5VSD8 79 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRM-211ENST00000580170 PANO1I0J062 215 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRM-211ENST00000580170 M0QZ58 72 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRM-211ENST00000580170 MAST4O15021 2626 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRM-211ENST00000580170 PCNTO95613 3336 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRM-211ENST00000580170 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087X002 238 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRM-211ENST00000580170 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRM-211ENST00000580170 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRM-211ENST00000580170 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRM-211ENST00000580170 LCE6AA0A183 80 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFAF8A1L188 74 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP54Q96N23 3096 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRM-211ENST00000580170 A8MU10 97 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CHD6Q8TD26 2715 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRM-211ENST00000580170 HTTP42858 3142 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRM-211ENST00000580170 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0C4DFX4 3053 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP13Q12802 2813 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 MGAQ8IWI9 3026 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 PLAC4Q8WY50 150 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 CENPEQ02224 2701 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRM-211ENST00000580170 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRM-211ENST00000580170 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRM-211ENST00000580170 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRM-211ENST00000580170 RPS29P62273 56 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRM-211ENST00000580170 TRANK1O15050 2925 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 STAB1Q9NY15 2570 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRM-211ENST00000580170 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRM-211ENST00000580170 A8MUU9 505 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRM-211ENST00000580170 LAMA3Q16787 3333 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRM-211ENST00000580170 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRM-211ENST00000580170 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF292O60281 2723 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRM-211ENST00000580170 TRIOO75962 3097 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRM-211ENST00000580170 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRM-211ENST00000580170 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRM-211ENST00000580170 BRCA2P51587 3418 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRM-211ENST00000580170 COL6A5A8TX70 2615 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRM-211ENST00000580170 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRM-211ENST00000580170 NOTCH1P46531 2555 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FRYQ5TBA9 3013 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf95Q9H7T3 257 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRM-211ENST00000580170 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRM-211ENST00000580170 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRM-211ENST00000580170 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TNP1P09430 55 aa11.59□□□□□ -0.55
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PTPRM-211ENST00000580170 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-211ENST00000580170 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CDH23Q9H251 3354 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ITPR2Q14571 2701 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRM-211ENST00000580170 KALRNO60229 2985 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRM-211ENST00000580170 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRM-211ENST00000580170 PP632Q6XCG6 107 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRM-211ENST00000580170 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRM-211ENST00000580170 H0YAA0 97 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRM-211ENST00000580170 P0C880 135 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ITPR1Q14643 2758 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRM-211ENST00000580170 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-211ENST00000580170 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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