RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 LIMD2Q9BT23 127 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 PRO1933Q9H354 126 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 LINC00575Q6W349 94 aa5.8□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 CD164Q04900 197 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 C1orf195Q5TG92 126 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZQY7 126 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 COX8AP10176 69 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 PCOTHQ58A44 107 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 C14orf144Q96I85 54 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H4GQ99525 98 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 hADV29S1A0JD25 119 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 VAMP3Q15836 100 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 Q5XG85 94 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 F8WEM9 126 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 CFC1BP0CG36 223 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 CFC1P0CG37 223 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 SPATA45Q537H7 98 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 IGFL1Q6UW32 110 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFE-213ENST00000494956 DLEU1O43261 78 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 H3BUT2 72 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 CLEC2BQ92478 149 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 RAB37Q96AX2 223 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 TCL1BO95988 128 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 Q6JHZ5 121 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 VAMP8Q9BV40 100 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 HIGD1BQ9P298 99 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 A0A0B4J2C4 111 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 FXYD2P54710 66 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 CEND1Q8N111 149 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-213ENST00000494956 MT1HP80294 61 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 PYY3Q5JQD4 70 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 H0YGX0 51 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 TRIAP1O43715 76 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 K7ERJ3 54 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 LST1O00453 97 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GV72 72 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 FABP2P12104 132 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WSZ3 146 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 H3BMG7 143 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 SVIPQ8NHG7 77 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 SNCGO76070 127 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 Q6Q795 121 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 TEN1Q86WV5 123 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PNM2 257 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 HSD52Q0P140 79 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 Q96NJ1 140 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GX51 115 aa5.55□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 PSMB2P49721 201 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 Q75L30 129 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 DSCR10P59022 87 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-213ENST00000494956 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.52□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 DNAL4O96015 105 aa5.51□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 M0R2T5 61 aa5.5□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.5□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.5□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.5□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.49□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 SIGMAR1Q99720 223 aa5.49□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 A8MUU9 505 aa5.48□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.48□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 IGKV4-1P06312 121 aa5.47□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 COX6CP09669 75 aa5.47□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.47□□□□□ -1.53
NELFE-213ENST00000494956 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.46□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.46□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.46□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 CCKP06307 115 aa5.46□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.45□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 VPS25Q9BRG1 176 aa5.45□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 TRACP01848 142 aa5.44□□□□□ -1.54
NELFE-213ENST00000494956 LINC00313P59037 77 aa5.44□□□□□ -1.54
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