RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477057.5

FDPS-211, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-211ENST00000477057 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
FDPS-211ENST00000477057 SMIM29Q86T20 159 aa7.22□□□□□ -1.25
FDPS-211ENST00000477057 LIMD2Q9BT23 127 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 A0A0G2JQZ4 141 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 TRIAP1O43715 76 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 CDIP1Q9H305 208 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.19□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 CLEC2BQ92478 149 aa7.18□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 DNAL4O96015 105 aa7.17□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 COX6CP09669 75 aa7.17□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 M0R143 59 aa7.16□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 FABP2P12104 132 aa7.16□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 TSTD3H0UI37 97 aa7.15□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.15□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.15□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.15□□□□□ -1.26
FDPS-211ENST00000477057 H3BUT2 72 aa7.14□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 CD164Q04900 197 aa7.14□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 TPRXLQ17RH7 258 aa7.14□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 A0A1B0GX51 115 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 GHRHP01286 108 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 Q6JHZ5 121 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 A0A1B0GV72 72 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 BATFQ16520 125 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 IGFL1Q6UW32 110 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 LPAP08519 4548 aa7.11□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 TCL1BO95988 128 aa7.1□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.1□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 LRP2P98164 4655 aa7.1□□□□□ -1.27
FDPS-211ENST00000477057 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.08□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 H3BMG7 143 aa7.08□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.07□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.06□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 C9orf92A6NGG3 77 aa7.06□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 C1orf195Q5TG92 126 aa7.04□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 H3BQ85 93 aa7.03□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.03□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 LST1O00453 97 aa7.03□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 Q5XG85 94 aa7.03□□□□□ -1.28
FDPS-211ENST00000477057 TRACP01848 142 aa7.02□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 ATXN8Q156A1 80 aa7.01□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.01□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 LYRM7Q5U5X0 104 aa7□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 TEN1Q86WV5 123 aa7□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 SS18L2Q9UHA2 77 aa7□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 A0A087WSZ3 146 aa6.99□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 VPS25Q9BRG1 176 aa6.99□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 XP32Q5T750 250 aa6.98□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.97□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.97□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 UBE2V1Q13404 147 aa6.97□□□□□ -1.29
FDPS-211ENST00000477057 Q6Q795 121 aa6.96□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.95□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 A0A1W2PNM2 257 aa6.94□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 CCKP06307 115 aa6.94□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 DSCR8Q96T75 97 aa6.94□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 A0A0U1RQV1 116 aa6.93□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 SIGMAR1Q99720 223 aa6.93□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 RNF213Q63HN8 5207 aa6.92□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.91□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 C9orf118A6NHY6 69 aa6.91□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 C9JAW5 83 aa6.91□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.9□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 TAX1BP3O14907 124 aa6.9□□□□□ -1.3
FDPS-211ENST00000477057 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.89□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 A0A1W2PPM0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.88□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 PCOTHQ58A44 107 aa6.88□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.87□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 MTURNQ8N3F0 131 aa6.87□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 IGKV4-1P06312 121 aa6.86□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.86□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.86□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 Q96NJ1 140 aa6.85□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.84□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.84□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.84□□□□□ -1.31
FDPS-211ENST00000477057 DSCR10P59022 87 aa6.83□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 MUC17Q685J3 4493 aa6.83□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 H3BT86 120 aa6.81□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.8□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 Q6ZQT0 140 aa6.8□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.8□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.79□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 PDE6GP18545 87 aa6.79□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.78□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.78□□□□□ -1.32
FDPS-211ENST00000477057 LINC00313P59037 77 aa6.77□□□□□ -1.33
FDPS-211ENST00000477057 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.77□□□□□ -1.33
FDPS-211ENST00000477057 MUC2Q02817 5179 aa6.77□□□□□ -1.33
FDPS-211ENST00000477057 Q75L30 129 aa6.75□□□□□ -1.33
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