RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 C9JAW5 83 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 F8WEM9 126 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01600Q96MT4 127 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-208ENST00000462602 OXTP01178 125 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2V1Q13404 147 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM29Q86T20 159 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BT86 120 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087X002 238 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 MOBPQ13875 183 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8NBF4 154 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GV90 55 aa5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6JHZ5 121 aa5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 F8W1H4 67 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 MTURNQ8N3F0 131 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-8P60410 259 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO0461Q9UI25 63 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 DSCR8Q96T75 97 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GV72 72 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 J3QL48 77 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 IGFL1Q6UW32 110 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1HL1P0DM35 61 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE6GP18545 87 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 CD164Q04900 197 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK1P00995 79 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 TEN1Q86WV5 123 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0G2JQZ4 141 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6Q795 121 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 MYCBP2O75592 4640 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 CCKP06307 115 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 ETDBQ3ZM63 59 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZQT0 140 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 LIMD2Q9BT23 127 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GW54 56 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PNM2 257 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS25Q9BRG1 176 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 Q5XG85 94 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WSZ3 146 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4-208ENST00000462602 TNXBP22105 4242 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4-208ENST00000462602 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4-208ENST00000462602 J3QR89 54 aa5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4-208ENST00000462602 ACYP1P07311 99 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 NREPQ16612 68 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf195Q5TG92 126 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 UBL5Q9BZL1 73 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 J3KT08 172 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00846Q9NV44 126 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR4Q16378 134 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 Q96NJ1 140 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV4-1P06312 121 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZVQ6 151 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGMAR1Q99720 223 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ERU9 68 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 BPY2O14599 106 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFB1O75438 58 aa5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MWP4 228 aa5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 TPRXLQ17RH7 258 aa5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GVX0 72 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL6P80162 114 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00643Q86TS7 51 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.2 ms