RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 PLAC4Q8WY50 150 aa7.4□□□□□ -1.22
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.4□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPRR1AP35321 89 aa7.4□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.39□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.37□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.37□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.36□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 STAB1Q9NY15 2570 aa7.35□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPRR1BP22528 89 aa7.34□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.34□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 OXTP01178 125 aa7.33□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 Q5VSD8 79 aa7.32□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 Q6ZR54 194 aa7.27□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.24□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 LCE6AA0A183 80 aa7.23□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-1P60331 282 aa7.21□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.21□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 PANO1I0J062 215 aa7.19□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.19□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-2P60368 255 aa7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 PCNTO95613 3336 aa7.17□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 ITPR3Q14573 2671 aa7.17□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 A8MU10 97 aa7.16□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 BPTFQ12830 3046 aa7.14□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 UTRNP46939 3433 aa7.13□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 NDUFAF8A1L188 74 aa7.12□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.1□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 A8MUU9 505 aa7.09□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 A6NN06 94 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 CEP350Q5VT06 3117 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 A0A087X002 238 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.01□□□□□ -1.29
VWDE-203ENST00000452576 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.98□□□□□ -1.29
VWDE-203ENST00000452576 TNP1P09430 55 aa6.94□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 C5orf42Q9H799 3197 aa6.93□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.93□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 NOTCH1P46531 2555 aa6.92□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 COL6A5A8TX70 2615 aa6.92□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.89□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 A0A0C4DFX4 3053 aa6.88□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 CENPEQ02224 2701 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 CFAP54Q96N23 3096 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 AKAP13Q12802 2813 aa6.83□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.82□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.8□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.8□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.78□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.74□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.74□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 CHD6Q8TD26 2715 aa6.73□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-8P60410 259 aa6.72□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 PP632Q6XCG6 107 aa6.69□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.67□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.66□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 A0A1B0GVY2 172 aa6.64□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 BRCA2P51587 3418 aa6.62□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 MGAQ8IWI9 3026 aa6.61□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.6□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 ZNF292O60281 2723 aa6.59□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 P0C880 135 aa6.58□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 LAMA3Q16787 3333 aa6.57□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 TRIOO75962 3097 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 HTTP42858 3142 aa6.54□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 H0YAA0 97 aa6.53□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.51□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.5□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.49□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 XP32Q5T750 250 aa6.48□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 FRYQ5TBA9 3013 aa6.45□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-10P60014 251 aa6.44□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 ITPR2Q14571 2701 aa6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.42□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.42□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms